Cellosaurus U2OS (CVCL_0042)
Cell line name | U2OS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | U-2 OS; U-2OS; U-2-OS; U2-OS; U20-S; U20S; 2T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_L856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: U2OS (RRID:CVCL_0042) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~36 hours (PubMed=21519327); ~25-30 hours (DSMZ=ACC-785). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: Cell surface proteome. Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Metabolome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Virome analysis using proteomics. Misspelling: U-205; Note=Occasionally. Misspelling: U205; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Bone, tibia; UBERON=UBERON_0000979. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=77569
Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Osteosarcoma (NCIt: C9145) Osteosarcoma (ORDO: Orphanet_668) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 15Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-96; CLS=300364; CCRID; Cosmic-CLP=909776; DSMZ=ACC-785; ECACC=92022711; KCLB=30096; PubMed=19787792; PubMed=25877200; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://141.61.102.20/mxdb/project/show/9191407937500 https://www.culturecollections.org.uk/products/cell-cultures/ecacc-cell-line-profiles/u-2-os/ https://www.proteinatlas.org/learn/cellines http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=U2-OS https://micro.magnet.fsu.edu/primer/techniques/fluorescence/gallery/cells/u2/u2cells.html https://www.olympus-lifescience.com/de/microscope-resource/primer/techniques/fluorescence/gallery/cells/epithelialindex/ https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/u/cell-lines-detail-92.html http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/U2OS_Farnham_protocol.pdf https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6081590; DOI=10.1002/ijc.2910020505 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=77569; DOI=10.1111/j.1399-0039.1978.tb01259.x PubMed=7017212; DOI=10.1093/jnci/66.6.1003 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2823272; DOI=10.1073/pnas.84.21.7716; PMCID=PMC299371 PubMed=2233717; DOI=10.1128/mcb.10.11.5772-5781.1990; PMCID=PMC361354 PubMed=8275086; DOI=10.1038/ng1193-230 PubMed=8040301; DOI=10.1172/JCI117360; PMCID=PMC295111 PubMed=8617485; DOI=10.1016/S0046-8177(96)90115-X PubMed=12645653; DOI=10.1016/S0165-4608(02)00685-4 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=15736406 PubMed=17354236; DOI=10.1002/ijc.22643 PubMed=17981215; DOI=10.1016/j.cancergencyto.2007.08.003 PubMed=18359981 PubMed=19787792; DOI=10.1002/gcc.20717 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=21519327; DOI=10.1038/labinvest.2011.72 PubMed=22068332; DOI=10.1038/msb.2011.82; PMCID=PMC3261713 PubMed=22278370; DOI=10.1074/mcp.M111.014050; PMCID=PMC3316730 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23144859; DOI=10.1371/journal.pone.0048262; PMCID=PMC3492335 PubMed=23649806; DOI=10.1083/jcb.201210031; PMCID=PMC3653305 PubMed=24136885; DOI=10.1002/pbc.24801; PMCID=PMC4154381 PubMed=24618588; DOI=10.1371/journal.pone.0091433; PMCID=PMC3950186 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25894527; DOI=10.1371/journal.pone.0121314; PMCID=PMC4404347 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29853780; DOI=10.1155/2018/3082526; PMCID=PMC5964616 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | Abcam; ab263976
Abcam; ab279979 ATCC; HTB-96 BCRC; 60187 BCRJ; 0304 CLS; 300364 DSMZ; ACC-785 ECACC; 92022711 ICLC; HTL11001 KCB; KCB 200962YJ KCLB; 30096 Ubigene; YC-C030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001272
CLO; CLO_0009454 MCCL; MCC:0000468 CLDB; cl53 CLDB; cl4579 CLDB; cl4580 CLDB; cl4581 CLDB; cl7217 cancercelllines; CVCL_0042 CCRID; 1101HUM-PUMC000028 CCRID; 3101HUMSCSP5030 CCRID; 3101HUMTCHu88 CCRID; 4201HUM-CCTCC00626 CCRID; 5301HUM-KCB09062YJ Cell_Model_Passport; SIDM01191 Cosmic-CLP; 909776 DepMap; ACH-000364 DSMZCellDive; ACC-785 LINCS_LDP; LCL-1431 Lonza; 676 TOKU-E; 3379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSR3V9ST6H
BioSample; SAMN03472549 BioSample; SAMN03472766 BioSample; SAMN10987914 ENCODE; ENCBS200HLU ENCODE; ENCBS266AAA ENCODE; ENCBS953RZO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307757
ChEMBL-Targets; CHEMBL615023 GDSC; 909776 PharmacoDB; U2OS_1619_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q28473037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSE54820 GEO; GSM170250 GEO; GSM185160 GEO; GSM185161 GEO; GSM287989 GEO; GSM287990 GEO; GSM320831 GEO; GSM827583 GEO; GSM879223 GEO; GSM887722 GEO; GSM888816 GEO; GSM1231597 GEO; GSM1231598 GEO; GSM1231599 GEO; GSM1231600 GEO; GSM1231601 GEO; GSM1231602 GEO; GSM1231603 GEO; GSM1231604 GEO; GSM1231605 GEO; GSM1231606 GEO; GSM1231607 GEO; GSM1231608 GEO; GSM1231609 GEO; GSM1231610 GEO; GSM1356565 GEO; GSM1356566 GEO; GSM1356567 GEO; GSM1356568 GEO; GSM1356569 GEO; GSM1356570 GEO; GSM1356571 GEO; GSM1356572 GEO; GSM1356573 GEO; GSM1356574 GEO; GSM1356575 GEO; GSM1356576 GEO; GSM1356577 GEO; GSM1356578 GEO; GSM1356579 GEO; GSM1356580 GEO; GSM1356581 GEO; GSM1356582 GEO; GSM1356583 GEO; GSM1356584 GEO; GSM1356585 GEO; GSM1356586 GEO; GSM1356587 GEO; GSM1670557 GEO; GSM1676324 GEO; GSM1701657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS247
MetaboLights; MTBLS292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687934
Cosmic; 755312 Cosmic; 909776 Cosmic; 931038 Cosmic; 931909 Cosmic; 1044081 Cosmic; 1044268 Cosmic; 1066238 Cosmic; 1074397 Cosmic; 1078392 Cosmic; 1082493 Cosmic; 1097758 Cosmic; 1529905 Cosmic; 1733128 Cosmic; 2009542 Cosmic; 2301583 Cosmic; 2440477 Cosmic; 2816207 IARC_TP53; 27710 LiGeA; CCLE_160 Progenetix; CVCL_0042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PRD000118
PRIDE; PXD000262 PRIDE; PXD000157 PRIDE; PXD000589 PRIDE; PXD000953 PRIDE; PXD000954 PRIDE; PXD001220 PRIDE; PXD002073 PRIDE; PXD002117 PRIDE; PXD002395 PRIDE; PXD003754 PRIDE; PXD009668 PRIDE; PXD017130 PRIDE; PXD020622 PRIDE; PXD024796 PRIDE; PXD025890 PRIDE; PXD028992 PRIDE; PXD030166 PRIDE; PXD030304 PRIDE; PXD030644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 48 |