Cellosaurus HT-1080 (CVCL_0317)
Cell line name | HT-1080 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Ht-1080; HT 1080; HT1080; HT 1080.T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HT-1080 (RRID:CVCL_0317) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Doubling time: 26 hours (PubMed=4132053); ~30 hours (DSMZ=ACC-315). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: HT1180; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Bone, pelvis, acetabulum; UBERON=UBERON_0001269. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
Source: CLS=300216
Source: DSMZCellDive=ACC-315
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Fibrosarcoma (NCIt: C3043) Fibrosarcoma (ORDO: Orphanet_2030) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 35Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-121; CCRID; CLS=300216; Cosmic-CLP=907064; DSMZ=ACC-315; ECACC=85111505; JCRB=IFO50354; JCRB=JCRB9113; KCLB=10121; CelloPub=CLPUB00698; PubMed=11416159; PubMed=17254797; PubMed=25877200; RCB=RCB1956; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://en.wikipedia.org/wiki/HT1080 https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-124.html https://tcpaportal.org/mclp/ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4132053; DOI=10.1002/1097-0142(197404)33:4<1027::AID-CNCR2820330419>3.0.CO;2-Z PubMed=375235; DOI=10.1073/pnas.76.3.1288; PMCID=PMC383236 PubMed=22282976; DOI=10.1093/carcin/1.1.21 PubMed=6652615; DOI=10.1016/0165-4608(83)90092-4 PubMed=6538202; DOI=10.1083/jcb.98.3.1133; PMCID=PMC2113122 PubMed=3986962; DOI=10.1093/carcin/6.4.549 PubMed=3558490; DOI=10.1002/jcp.1041300303 PubMed=3335022 PubMed=3413074; DOI=10.1073/pnas.85.16.6042; PMCID=PMC281901 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 CLPUB00698 PubMed=17254797; DOI=10.1016/j.biologicals.2006.10.001 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24726063; DOI=10.1186/1756-9966-33-33; PMCID=PMC4022359 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=26368816; DOI=10.1371/journal.pone.0133813; PMCID=PMC4569544 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-121
ATCC; CRL-7951 - Discontinued BCRC; 60037 BCRJ; 0110 CCTCC; GDC0105 CLS; 300216 DSMZ; ACC-315 ECACC; 85111505 IBRC; C10104 ICLC; HTL98016 IZSLER; BS TCL 27 JCRB; IFO50354 JCRB; JCRB9113 KCB; KCB 2013029YJ KCLB; 10121 NCBI_Iran; C437 RCB; RCB1956 - Discontinued TKG; TKG 0202 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004266
CLO; CLO_0004276 MCCL; MCC:0000210 CLDB; cl1735 CLDB; cl1736 CLDB; cl1737 CLDB; cl1738 CLDB; cl1740 CLDB; cl1741 CLDB; cl1742 CLDB; cl4913 cancercelllines; CVCL_0317 CCRID; 1101HUM-PUMC000070 CCRID; 3101HUMTCHu170 CCRID; 4201HUM-CCTCC00105 Cell_Model_Passport; SIDM00828 Cosmic-CLP; 907064 DepMap; ACH-000054 DSMZCellDive; ACC-315 IGRhCellID; HT1080 LINCS_LDP; LCL-1435 Lonza; 744 TOKU-E; 1963 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001282 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821563
BioSample; SAMN01821634 BioSample; SAMN01821685 BioSample; SAMN01821731 BioSample; SAMN03471913 BioSample; SAMN10987635 ENCODE; ENCBS039VHD ENCODE; ENCBS225AAA ENCODE; ENCBS512AAA ENCODE; ENCBS513AAA ENCODE; ENCBS617SGR ENCODE; ENCBS688VJF ENCODE; ENCBS798NML ENCODE; ENCBS816VMN ENCODE; ENCBS937RAY | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 279 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308396
ChEMBL-Targets; CHEMBL614580 GDSC; 907064 PharmacoDB; HT1080_625_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q5636047 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002059
EFO; EFO_0022394 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM185089 GEO; GSM185090 GEO; GSM256074 GEO; GSM256075 GEO; GSM256076 GEO; GSM256077 GEO; GSM256078 GEO; GSM256079 GEO; GSM256080 GEO; GSM256081 GEO; GSM256082 GEO; GSM256083 GEO; GSM256084 GEO; GSM256085 GEO; GSM256086 GEO; GSM256087 GEO; GSM256088 GEO; GSM256089 GEO; GSM256090 GEO; GSM256091 GEO; GSM256092 GEO; GSM256093 GEO; GSM256094 GEO; GSM256095 GEO; GSM256096 GEO; GSM256097 GEO; GSM256098 GEO; GSM256099 GEO; GSM256100 GEO; GSM256101 GEO; GSM256102 GEO; GSM256103 GEO; GSM256104 GEO; GSM256105 GEO; GSM256106 GEO; GSM256107 GEO; GSM256108 GEO; GSM256109 GEO; GSM256110 GEO; GSM256111 GEO; GSM256112 GEO; GSM256113 GEO; GSM256114 GEO; GSM827307 GEO; GSM887136 GEO; GSM888207 GEO; GSM1669908 GEO; GSM1676302 GEO; GSM1701637 GEO; GSM3585511 GEO; GSM3585512 GEO; GSM3585513 GEO; GSM3585514 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 716177
Cosmic; 716188 Cosmic; 724819 Cosmic; 907064 Cosmic; 912000 Cosmic; 1045409 Cosmic; 1067221 Cosmic; 1933190 Cosmic; 2009505 Cosmic; 2301553 Cosmic; 2307731 Cosmic; 2560245 Cosmic; 2764533 IARC_TP53; 21378 LiGeA; CCLE_463 Progenetix; CVCL_0317 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 49 |