Cellosaurus WA09 (CVCL_9773)
Cell line name | WA09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | WA 09; WA-09; WA9; H9; H9.hESCs; H9 ESC; H9 hES; H9ES; GE09; WAe003-A; WICELLe003-A; WAe009-A; WA09-PCBC; PCBC02hse2014030502; SC14-067; UKERe008-A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_9773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: WA09 (RRID:CVCL_9773) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Clinical grade pluripotent cell line. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: NHBLI Progenitor Cell Biology Consortium (PCBC) collection. From: University of Wisconsin; Madison; USA. Registration: NIH Human Embryonic Stem Cell Registry; NIHhESC-10-0062. Registration: Swiss research registry; BAG-hES-IMP-0016. Registration: UK Stem Cell Bank (UKSCB); Steering comm. appl. SCSC06-18/SCSC11-06. Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep phosphoproteome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H2AK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK12ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK15ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K18ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K56ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K20me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K8ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K91ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Mitochondrial proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by serial analysis of gene expression (SAGE). Anecdotal: WA01, WA07, WA09, WA13 and WA14 were the first human embryonic stem cells to be established. Derived from site: In situ; Blastocyst; UBERON=UBERON_0000358. Cell type: Embryonic stem cell; CL=CL_0002322. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=16919167
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Blastocyst stage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Embryonic stem cell | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=16919167; PubMed=29246576; WiCell=wa09 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/BG02ES_and_H9ES_Myers_protocols.pdf https://strap.nci.nih.gov/celline_detail.php?sample_id=88 https://stemcelldb.nih.gov/cellLineDetails.do?id=13 https://news.wisc.edu/nih-reapproves-wicells-h9-and-three-other-wisconsin-stem-cell-lines-for-federally-funded-research/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9804556; DOI=10.1126/science.282.5391.1145 PubMed=14745950; DOI=10.1002/dvdy.10431 PubMed=16388305; DOI=10.1038/nbt1177 PubMed=16919167; DOI=10.1186/1741-7007-4-28; PMCID=PMC1601965 PubMed=17570852; DOI=10.1186/gb-2007-8-6-r113; PMCID=PMC2394759 PubMed=17572666; DOI=10.1038/nbt1318 PubMed=20641038; DOI=10.1002/stem.471; PMCID=PMC2996086 PubMed=20736931; DOI=10.1038/mt.2010.179; PMCID=PMC2997587 PubMed=21295703; DOI=10.1016/j.cell.2010.12.032; PMCID=PMC3063454 PubMed=21983960; DOI=10.1038/nmeth.1699; PMCID=PMC3432645 PubMed=21936705; DOI=10.1089/scd.2011.0400 PubMed=22514597; DOI=10.1371/journal.pone.0030743; PMCID=PMC3326006 PubMed=22802639; DOI=10.1073/pnas.1209979109; PMCID=PMC3411998 PubMed=23117585; DOI=10.1016/j.scr.2012.09.002; PMCID=PMC3590800 PubMed=24259714; DOI=10.1073/pnas.1319061110; PMCID=PMC3870695 PubMed=27293150; DOI=10.1016/j.stemcr.2016.05.006; PMCID=PMC4944587 PubMed=27476965; DOI=10.1016/j.stem.2016.06.019 PubMed=27688775; DOI=10.1155/2016/3826249; PMCID=PMC5023833 PubMed=28435121; DOI=10.1016/j.jprot.2017.04.017 PubMed=28445466; DOI=10.1038/nature22312; PMCID=PMC5427175 PubMed=28664172; DOI=10.1016/j.dib.2017.05.036; PMCID=PMC5480819 PubMed=29246576; DOI=10.1016/j.scr.2017.08.004 PubMed=29861859; DOI=10.18632/oncotarget.25353; PMCID=PMC5982739 PubMed=30388422; DOI=10.1016/j.stem.2018.10.009 PubMed=35805069; DOI=10.3390/cells11131984; PMCID=PMC9265327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | WiCell; wa09
WiCell; wa09-cgmp-material WiCell; wa09-matched-research WiCell; wa09-pcbc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037313
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Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0006062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q27555433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM239975
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Proteomic databases | PRIDE; PXD003903
PRIDE; PXD006271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |