Cellosaurus Jurkat E6.1 (CVCL_0367)
Cell line name | Jurkat E6.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | JurkatE6-1; Jurkat E6-1; Jurkat, Clone E6-1; Jurkat Clone E6-1; Jurkat (clone E6-1); JURKAT E-6.1; JURKAT E-61; Jurkat-CloneE61; Jurkat-E6; Jurkat E6; J.E6-1; E6-1; Jurkat J6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_4530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Jurkat E6.1 (RRID:CVCL_0367) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Space-flown cell line (cellonaut). Part of: Tumor Immunology Bank (TIB) collection from Salk (transferred to ATCC in 1981). Population: Caucasian. Doubling time: 20.7 +- 2.2 hours (PubMed=10468210). Omics: Cell surface proteome. Omics: Deep phosphoproteome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Anecdotal: Have been flown in space on shuttle flights STS-76, STS-80 and STS-95 to study apoptosis and cytoskeleton modifications (PubMed=9707173; PubMed=10832058; PubMed=11481229; PubMed=11669127). Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0065 (Jurkat) Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 14Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=TIB-152; CCRID; CLS=300223; ECACC=88042803; KCLB=40152; PubMed=11416159; PubMed=25877200; PubMed=32938764 Markers:
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Web pages | http://www.nibsc.org/Default.aspx?pageid=597&id=0027&theme=default | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8316623; DOI=10.2307/3578190 PubMed=7592872; DOI=10.1074/jbc.270.44.26533 PubMed=9707173; DOI=10.1096/fasebj.12.11.1007 PubMed=10468210; DOI=10.1016/S0891-5849(99)00074-X PubMed=10832058; DOI=10.1016/S0531-5565(00)00090-5 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=11481229; DOI=10.1096/fj.00-0820fje PubMed=11669127; DOI=10.1016/S0094-5765(01)00116-3 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=18842727; DOI=10.1128/JVI.01726-08; PMCID=PMC2593302 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=23933134; DOI=10.1016/j.jprot.2013.07.019 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25894527; DOI=10.1371/journal.pone.0121314; PMCID=PMC4404347 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26546556; DOI=10.1016/j.jprot.2015.10.029 PubMed=28464451; DOI=10.1002/pmic.201600470 PubMed=29739316; DOI=10.1186/s12864-018-4718-6; PMCID=PMC5941560 PubMed=32938764; DOI=10.1128/JVI.01334-20; PMCID=PMC7654282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; TIB-152
BCRC; 60424 BCRJ; 0125 BEI_Resources; ARP-177 CCTCC; GDC0094 CLS; 300223 ECACC; 88042803 IZSLER; BS TCL 110 KCB; KCB 94008YJ KCLB; 40152 NCBI_Iran; C121 Ubigene; YC-D012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007044
CLO; CLO_0007045 MCCL; MCC:0000260 CLDB; cl2962 CLDB; cl5213 cancercelllines; CVCL_0367 CCRID; 1101HUM-PUMC000075 CCRID; 1101HUM-PUMC000348 CCRID; 1102HUM-NIFDC00049 CCRID; 3101HUMSCSP513 CCRID; 3101HUMTCHU123 CCRID; 4201HUM-CCTCC00094 Cell_Model_Passport; SIDM01244 LINCS_LDP; LCL-1030 TOKU-E; 2081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472194
ENCODE; ENCBS407ENC ENCODE; ENCBS429ENC ENCODE; ENCBS550BVM ENCODE; ENCBS551ZKL ENCODE; ENCBS606GXJ ENCODE; ENCBS661UFZ ENCODE; ENCBS732UVO ENCODE; ENCBS755XWL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4295390
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296446 PharmacoDB; Jurkat_Clone_E61_713_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54899132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSE101101 GEO; GSM472928 GEO; GSM510511 GEO; GSM827151 GEO; GSM923424 GEO; GSM945267 GEO; GSM945268 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 913419
Progenetix; CVCL_0367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PRD000345
PRIDE; PXD000148 PRIDE; PXD000589 PRIDE; PXD002871 PRIDE; PXD004415 PRIDE; PXD010176 PRIDE; PXD032302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |