Cellosaurus HeLa S3 (CVCL_0058)
Cell line name | HeLa S3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HeLa s3; HeLa-S3; HELA-S3; HeLa/S3; HeLa.S3; HeLa S 3; HeLa S-3; HeLaS3; HeLa, S3 clone; S3-HeLa; S3 HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0058 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HeLa S3 (RRID:CVCL_0058) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: ENCODE project common cell types; tier 2. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: African American. Virology: Has at least 4 five HPV18 integration sites in the genome (PubMed=26550473). Doubling time: ~48 hours (DSMZ=ACC-161). Transformant: NCBI_TaxID; 333761; Human papillomavirus type 18 (HPV18). Omics: ChIP-seq epigenome analysis. Omics: CTCF ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K20me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Hi-C chromosome conformation analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by single cell RNAseq. Anecdotal: The 'S' series of HeLa clones was named after Dr. Florence Sabin. Derived from site: In situ; Uterus, cervix; UBERON=UBERON_0000002. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Human papillomavirus-related cervical adenocarcinoma (NCIt: C27677) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0030 (HeLa) Children:
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Sex of cell | Female | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 30Y6M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-2.2; CCRID; CLS=300384; DSMZ=ACC-161; ECACC=87110901; JCRB=IFO50011; JCRB=JCRB9010; KCLB=10002.2; PubMed=11416159; PubMed=14518029; RCB=RCB0191; TKG=TKG 0444 Markers:
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Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/HeLa-S3_protocol.pdf https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-157.html http://immortalcells.blogspot.ch/2011/12/hela-vs-hela-s3.html | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=16589695; DOI=10.1073/pnas.41.7.432; PMCID=PMC528114 PubMed=13286432; DOI=10.1084/jem.103.2.273; PMCID=PMC2136583 PubMed=13531635; DOI=10.1007/BF00340146 PubMed=1180926; DOI=10.1016/0006-291x(75)90551-3 PubMed=978597; DOI=10.1269/jrr.17.154 PubMed=566722; DOI=10.1007/BF02616110 PubMed=6256643; DOI=10.1038/288724a0 PubMed=6825208; DOI=10.1093/carcin/4.2.199 PubMed=3986962; DOI=10.1093/carcin/6.4.549 PubMed=3756862 PubMed=3180844; DOI=10.1159/000132579 PubMed=1522048; DOI=10.1007/BF02634140 CLPUB00481 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D DOI=10.11418/jtca1981.17.3_101 PubMed=10338214; DOI=10.1016/S0092-8674(00)80760-6 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=14518029; DOI=10.1002/pros.10290 PubMed=19450234; DOI=10.2144/000113089; PMCID=PMC2696096 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112; PMCID=PMC3589544 PubMed=23925245; DOI=10.1038/nature12064; PMCID=PMC3740412 PubMed=24185095; DOI=10.1038/nbt.2727; PMCID=PMC4117202 PubMed=26550473; DOI=10.1186/s13742-015-0091-4; PMCID=PMC4635585 PubMed=30175587; DOI=10.1021/acs.jproteome.8b00392 PubMed=30778230; DOI=10.1038/s41587-019-0037-y PubMed=33205894; DOI=10.15252/msb.20209946; PMCID=PMC7672610 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-2.2
ATCC; CRL-7924 - Discontinued BCRC; 60101 CCTCC; GDC0193 CLS; 300384 DSMZ; ACC-161 ECACC; 87110901 ICLC; HTL95020 IZSLER; BS TCL 22 JCRB; IFO50011 JCRB; JCRB9010 KCLB; 10002.2 NCBI_Iran; C572 RCB; RCB0191 RCB; RCB1525 RCB; RCB3682 TKG; TKG 0444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003695
CLO; CLO_0003696 CLO; CLO_0003699 CLO; CLO_0050921 CLO; CLO_0050936 MCCL; MCC:0000220 CLDB; cl1616 CLDB; cl1617 CLDB; cl1619 CLDB; cl1620 CLDB; cl1621 CLDB; cl1622 CCRID; 1101HUM-PUMC000188 CCRID; 1102HUM-NIFDC00009 CCRID; 4201HUM-CCTCC00193 DSMZCellDive; ACC-161 Lonza; 877 TOKU-E; 1437 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0000568 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSRGTEEYSL
BioSample; SAMN03472408 BioSample; SAMN03472767 ENCODE; ENCBS031GUL ENCODE; ENCBS061SJE ENCODE; ENCBS075PNA ENCODE; ENCBS094KYE ENCODE; ENCBS113ENC ENCODE; ENCBS146YHK ENCODE; ENCBS163VBG ENCODE; ENCBS199XIN ENCODE; ENCBS229UDI ENCODE; ENCBS254ZSR ENCODE; ENCBS292TEU ENCODE; ENCBS352IHZ ENCODE; ENCBS376OKH ENCODE; ENCBS403WXR ENCODE; ENCBS417UAY ENCODE; ENCBS423QWP ENCODE; ENCBS424JTA ENCODE; ENCBS432ENC ENCODE; ENCBS434SUM ENCODE; ENCBS450RLH ENCODE; ENCBS468RLW ENCODE; ENCBS493MKF ENCODE; ENCBS500SDW ENCODE; ENCBS529RSF ENCODE; ENCBS575PET ENCODE; ENCBS577WSP ENCODE; ENCBS580FYL ENCODE; ENCBS585KIN ENCODE; ENCBS598ZWC ENCODE; ENCBS635AAA ENCODE; ENCBS636AAA ENCODE; ENCBS637AAA ENCODE; ENCBS646PGB ENCODE; ENCBS647UNF ENCODE; ENCBS655ARO ENCODE; ENCBS656NDW ENCODE; ENCBS658BKJ ENCODE; ENCBS681BHB ENCODE; ENCBS684AAA ENCODE; ENCBS685AAA ENCODE; ENCBS686AAA ENCODE; ENCBS687AAA ENCODE; ENCBS688AAA ENCODE; ENCBS689AAA ENCODE; ENCBS714AAA ENCODE; ENCBS735AAA ENCODE; ENCBS736AAA ENCODE; ENCBS737AAA ENCODE; ENCBS738AAA ENCODE; ENCBS739AAA ENCODE; ENCBS740AAA ENCODE; ENCBS748HNU ENCODE; ENCBS804AAA ENCODE; ENCBS805AAA ENCODE; ENCBS812AOY ENCODE; ENCBS822AAA ENCODE; ENCBS823AAA ENCODE; ENCBS833ISA ENCODE; ENCBS834AAA ENCODE; ENCBS838AAA ENCODE; ENCBS839AAA ENCODE; ENCBS854BZN ENCODE; ENCBS877WSH ENCODE; ENCBS890POO ENCODE; ENCBS899VUW ENCODE; ENCBS979JZP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3886002
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296436 PubChem_Cell_line; CVCL_0058 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54882556 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002791 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM472905
GEO; GSM472916 GEO; GSM472932 GEO; GSM733669 GEO; GSM733682 GEO; GSM733684 GEO; GSM733689 GEO; GSM733696 GEO; GSM733711 GEO; GSM733734 GEO; GSM733756 GEO; GSM733785 GEO; GSM736510 GEO; GSM736564 GEO; GSM749721 GEO; GSM749729 GEO; GSM749739 GEO; GSM798322 GEO; GSM803454 GEO; GSM803455 GEO; GSM803478 GEO; GSM803533 GEO; GSM816436 GEO; GSM816643 GEO; GSM816633 GEO; GSM822273 GEO; GSM822285 GEO; GSM822286 GEO; GSM923449 GEO; GSM935272 GEO; GSM935276 GEO; GSM935290 GEO; GSM935302 GEO; GSM935317 GEO; GSM935318 GEO; GSM935320 GEO; GSM935326 GEO; GSM935328 GEO; GSM935341 GEO; GSM935342 GEO; GSM935351 GEO; GSM935362 GEO; GSM935365 GEO; GSM935366 GEO; GSM935367 GEO; GSM935369 GEO; GSM935370 GEO; GSM935383 GEO; GSM935384 GEO; GSM935395 GEO; GSM935405 GEO; GSM935408 GEO; GSM935416 GEO; GSM935432 GEO; GSM935435 GEO; GSM935436 GEO; GSM935459 GEO; GSM935476 GEO; GSM935484 GEO; GSM935486 GEO; GSM935489 GEO; GSM935498 GEO; GSM935500 GEO; GSM935508 GEO; GSM935511 GEO; GSM935552 GEO; GSM935553 GEO; GSM935554 GEO; GSM935555 GEO; GSM935560 GEO; GSM935561 GEO; GSM935570 GEO; GSM935571 GEO; GSM935578 GEO; GSM935582 GEO; GSM935606 GEO; GSM935615 GEO; GSM935625 GEO; GSM935635 GEO; GSM935636 GEO; GSM935637 GEO; GSM935638 GEO; GSM945201 GEO; GSM945208 GEO; GSM945230 GEO; GSM945253 GEO; GSM1003480 GEO; GSM1003483 GEO; GSM1003520 GEO; GSM1003618 GEO; GSM2423737 GEO; GSM2423738 GEO; GSM4224315 GEO; GSM4226257 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 846181
Cosmic; 1201780 Cosmic; 1324209 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PRD000146
PRIDE; PXD000212 PRIDE; PXD000674 PRIDE; PXD000964 PRIDE; PXD001200 PRIDE; PXD001385 PRIDE; PXD001592 PRIDE; PXD002436 PRIDE; PXD002802 PRIDE; PXD003346 PRIDE; PXD003709 PRIDE; PXD004655 PRIDE; PXD006322 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | dbGAP; phs000665.v9.p1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |