Cellosaurus HaCaT (CVCL_0038)
Cell line name | HaCaT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HaCAT; HACAT; Hacat | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HaCaT (RRID:CVCL_0038) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Population: Caucasian. Virology: Susceptible to infection by Zika virus (ZIKV) (PubMed=29468137). Doubling time: 28 hours (PubMed=32938951). Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Metabolome analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: Although HaCaT is distributed by a number of sources, the only official DKFZ-approved supplier is CLS. Derived from site: In situ; Back, skin, epidermis; UBERON=UBERON_0001068+UBERON_0001003. Cell type: Keratinocyte; CL=CL_0000312. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: CLS=300493
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 62Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Spontaneously immortalized cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID; CLS=300493; DSMZ=ACC-771; PubMed=11416159; PubMed=21868764; PubMed=35072517; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://en.wikipedia.org/wiki/HaCaT https://www.proteinatlas.org/learn/cellines https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-347.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2450098; DOI=10.1083/jcb.106.3.761; PMCID=PMC2115116 PubMed=8162337; DOI=10.1111/j.1600-0625.1993.tb00030.x PubMed=8504475; DOI=10.1093/carcin/14.5.833 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=9406811; DOI=10.1111/1523-1747.ep12340708 PubMed=10350023; DOI=10.1023/A:1011945212831 PubMed=10523843; DOI=10.1038/sj.onc.1202934 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=11583982; DOI=10.1016/S0002-9440(10)62541-2; PMCID=PMC1850484 PubMed=15389883; DOI=10.1002/jcb.20212 PubMed=20097197; DOI=10.1016/j.yexcr.2010.01.020 PubMed=20100199; DOI=10.1111/j.1600-0625.2009.01026.x; PMCID=PMC2891305 PubMed=21185708; DOI=10.1016/j.jnutbio.2010.08.004 PubMed=21269460; DOI=10.1186/1752-0509-5-17; PMCID=PMC3039570 PubMed=21868764; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-11-0690; PMCID=PMC3229662 PubMed=24155234; DOI=10.1007/7651_2013_42 PubMed=26989177; DOI=10.1242/dev.133728; PMCID=PMC4874484 PubMed=29468137; DOI=10.5501/wjv.v7.i1.10; PMCID=PMC5807893 PubMed=29660373; DOI=10.1016/j.bbagen.2018.04.012 PubMed=31629070; DOI=10.1016/j.tiv.2019.104666 PubMed=32938951; DOI=10.1038/s41598-020-71315-0; PMCID=PMC7494900 PubMed=33718544; DOI=10.1016/j.dib.2021.106871; PMCID=PMC7921465 PubMed=35072517; DOI=10.1289/EHP9676; PMCID=PMC8785870 PubMed=35647242; DOI=10.1016/j.dib.2022.108274; PMCID=PMC9130082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; T0020001/117
BCRJ; 0341 - Discontinued CCTCC; GDC0106 CLS; 300493 DSMZ; ACC-771 - Discontinued ICLC; HL14001 - Discontinued IZSLER; BS CL 168 KCB; KCB 200442YJ Ubigene; YC-A018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLDB; cl7229
CCRID; 1101HUM-PUMC000373 CCRID; 4201HUM-CCTCC00106 DSMZCellDive; ACC-771 Lonza; 56 TOKU-E; 3890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0000552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308509
ChEMBL-Targets; CHEMBL614392 PubChem_Cell_line; CVCL_0038 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q5636366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSE57080
GEO; GSM913344 GEO; GSM913345 GEO; GSM960278 GEO; GSM960279 GEO; GSM960280 GEO; GSM960286 GEO; GSM960287 GEO; GSM960288 GEO; GSM960294 GEO; GSM960295 GEO; GSM960296 GEO; GSM1375594 GEO; GSM1375595 GEO; GSM1375596 GEO; GSM1375597 GEO; GSM1375598 GEO; GSM1375599 GEO; GSM1375600 GEO; GSM1375601 GEO; GSM1375602 GEO; GSM1375603 GEO; GSM1375604 GEO; GSM1375605 GEO; GSM1861816 GEO; GSM1861817 GEO; GSM1861820 GEO; GSM1861821 GEO; GSM2112559 GEO; GSM2112563 GEO; GSM2495796 GEO; GSM2495797 GEO; GSM2495798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Medical resources | MeSH; D000084282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1530737
IARC_TP53; 1820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000496
PRIDE; PXD000670 PRIDE; PXD002460 PRIDE; PXD007789 PRIDE; PXD013113 PRIDE; PXD017536 PRIDE; PXD033538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |