Cellosaurus Ramos (CVCL_0597)
Cell line name | Ramos | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RAMOS; Ramos 1; RA 1; RA.1; Ra #1; Ra No. 1; Ramos(RA1); Ramos-RA1; Ramos (RA 1); Ramos (RA #1); Ramos (RA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Ramos (RRID:CVCL_0597) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: NCI Pediatric Preclinical Testing Program (PPTP) cell line panel. Population: Caucasian. Virology: EBV-negative. Doubling time: 20.4 +- 1.5 hours (PubMed=9225077); 23 hours (PubMed=8402660); 26 hours (PubMed=9563901); 14 hours (PubMed=20922763); ~48 hours (DSMZ=ACC-603). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10739008; PubMed=11226526). Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Proteomics. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. Cell type: B-cell; CL=CL_0000236. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
Source: CLS=302007
Source: DSMZCellDive=ACC-603
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Disease | Burkitt lymphoma (NCIt: C2912) Burkitt lymphoma (ORDO: Orphanet_543) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1596; CCRID; CLS=302007; COG; DepMap=ACH-001636; DSMZ=ACC-603; ECACC=85030802; JCRB=JCRB9119; KCLB=21596; PubMed=20922763; PubMed=25877200; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; COPE; -; http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=Ramos Info; MCLP; -; https://tcpaportal.org/mclp/ Info; Thermo Fisher; -; https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/r/cell-lines-detail-485.html Provider; Altogen; Xenograft model; https://altogenlabs.com/xenograft-models/lymphoma-xenograft/ramos-xenograft-model/ Provider; CCR; -; https://www.cccells.org/cellreqs-ncipptp.php | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=181343; DOI=10.1159/000149930 PubMed=62724; DOI=10.1002/ijc.2910180513 PubMed=175026; DOI=10.1002/ijc.2910170203 PubMed=7316467; DOI=10.1111/j.1469-1809.1980.tb00953.x PubMed=6286763; DOI=10.4049/jimmunol.129.3.1336 PubMed=6231253; DOI=10.1002/ijc.2910330407 PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=2998993 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2835030; DOI=10.1016/S0385-8146(87)80025-1 PubMed=3026973; DOI=10.1002/ijc.2910390215 PubMed=1850347; DOI=10.1210/endo-128-5-2266 PubMed=1915267; DOI=10.1002/j.1460-2075.1991.tb07837.x; PMCID=PMC452998 PubMed=2052620; DOI=10.1073/pnas.88.12.5413; PMCID=PMC51883 PubMed=8316623; DOI=10.2307/3578190 PubMed=8344493; DOI=10.1096/fasebj.7.10.8344493 PubMed=8402660 PubMed=8515068; DOI=10.4049/jimmunol.150.12.5418 PubMed=7757991 PubMed=8896424; DOI=10.1182/blood.V88.9.3562.bloodjournal8893562 PubMed=9192833 PubMed=9225077; DOI=10.1016/S0145-2126(97)00126-4 PubMed=9473234; DOI=10.1182/blood.V91.5.1680 PubMed=9563901 PubMed=9973220 PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 PubMed=10918597; DOI=10.1038/sj.onc.1203686 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=12967475; DOI=10.1111/j.1349-7006.2003.tb01518.x; PMCID=PMC11160262 PubMed=18211290; DOI=10.1111/j.1365-2184.2007.00500.x; PMCID=PMC6495949 PubMed=20922763; DOI=10.1002/pbc.22801; PMCID=PMC3005554 PubMed=22885699; DOI=10.1038/nature11378; PMCID=PMC3609867 PubMed=24590883; DOI=10.1002/gcc.22161 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1596
BCRC; 60252 BEI_Resources; ARP-9938 CLS; 302007 DSMZ; ACC-603 ECACC; 85030802 ECACC; 91030710 JCRB; JCRB9119 KCLB; 21596 NCBI_Iran; C128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008738
CLO; CLO_0008739 MCCL; MCC:0000410 CLDB; cl4096 CLDB; cl4097 CLDB; cl4098 cancercelllines; CVCL_0597 CCRID; 1101HUM-PUMC000048 CCRID; 1102HUM-NIFDC00052 Cell_Model_Passport; SIDM01094 CGH-DB; 9205-4 DepMap; ACH-001636 DSMZCellDive; ACC-603 FCS-free; 243-2-490-3-4-12 LINCS_HMS; 50811 LINCS_LDP; LCL-1097 Lonza; 725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821590
BioSample; SAMN01821657 BioSample; SAMN03472718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307664
ChEMBL-Targets; CHEMBL614629 PharmacoDB; RAMOS_1283_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54949198 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM99388 GEO; GSM987747 GEO; GSM987748 GEO; GSM987749 GEO; GSM1374843 GEO; GSM1374844 GEO; GSM3150254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 929817
Cosmic; 931111 Cosmic; 991547 Cosmic; 998719 Cosmic; 1037704 Cosmic; 1226864 Cosmic; 1509204 Cosmic; 1517660 Cosmic; 1762459 Cosmic; 1818347 Cosmic; 2750875 Cosmic; 2759408 Cosmic; 2814542 Cosmic; 2823075 IARC_TP53; 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000447
PRIDE; PXD012087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 45 |