Cellosaurus LNCaP (CVCL_0395)
Cell line name | LNCaP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LNCAP; LNCap; Ln-Cap; Lymph Node Carcinoma of the prostate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LNCaP (RRID:CVCL_0395) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Space-flown cell line (cellonaut). Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Caucasian. Doubling time: ~60 hours (DSMZ=ACC-256). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=23671654). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep phosphoproteome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Glycoproteome analysis by proteomics. Omics: GPI-anchored proteins analysis by proteomics. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by serial analysis of gene expression (SAGE). Omics: Virome analysis using proteomics. Derived from site: Metastatic; Left supraclavicular lymph node; UBERON=UBERON_8480056. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Prostate carcinoma (NCIt: C4863) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 50Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID=1101HUM-PUMC000040; CLS=300265; DSMZ=ACC-256; PubMed=11416159; PubMed=14518029; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.lncap.com/ https://en.wikipedia.org/wiki/LNCaP http://141.61.102.20/mxdb/project/show/9191407937500 http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/LNCaP_Crawford_protocol.pdf https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/l/cell-lines-detail-136.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | CLPUB00410 PubMed=6831420 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3335022 PubMed=2734981; DOI=10.1007/BF00262025 PubMed=8687134 PubMed=9018337; DOI=10.1002/(SICI)1097-0045(19970101)30:1<58::AID-PROS9>3.0.CO;2-H PubMed=9090379; DOI=10.1038/ng0497-356 PubMed=9460501; DOI=10.1016/S0165-4608(97)00060-5 PubMed=10702678; DOI=10.1159/000015432 PubMed=10972993; DOI=10.1002/1098-2744(200008)28:4<236::AID-MC6>3.0.CO;2-H PubMed=11135431; DOI=10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<::AID-GCC1076>3.0.CO;2-E PubMed=11172901; DOI=10.1016/S0165-4608(00)00339-3 PubMed=11304728; DOI=10.1002/pros.1045 PubMed=11414198; DOI=10.1007/s004320000207 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=12606952; DOI=10.1038/sj.onc.1206247 PubMed=12725112; DOI=10.1385/1-59259-372-0:21 PubMed=14518029; DOI=10.1002/pros.10290 CLPUB00698 PubMed=15162376; DOI=10.1002/pros.20031 PubMed=15486987; DOI=10.1002/pros.20158 PubMed=22213130; DOI=10.1002/pros.22480 PubMed=22278370; DOI=10.1074/mcp.M111.014050; PMCID=PMC3316730 PubMed=23671654; DOI=10.1371/journal.pone.0063056; PMCID=PMC3646030 PubMed=24587179; DOI=10.1371/journal.pone.0090002; PMCID=PMC3938550 PubMed=24618588; DOI=10.1371/journal.pone.0091433; PMCID=PMC3950186 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26256267; DOI=10.1074/mcp.M115.047928; PMCID=PMC4597149 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26972028; DOI=10.1016/j.jprot.2016.03.008 PubMed=27036029; DOI=10.18632/oncotarget.8456; PMCID=PMC5041979 PubMed=27141528; DOI=10.1016/j.dib.2016.04.001; PMCID=PMC4838930 PubMed=29233929; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-17-1924; PMCID=PMC5983359 PubMed=29660373; DOI=10.1016/j.bbagen.2018.04.012 PubMed=29739788; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-18-0410; PMCID=PMC6125187 PubMed=30787054; DOI=10.1158/1055-9965.EPI-18-1132; PMCID=PMC6548687 PubMed=35502546; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-22-1065; PMCID=PMC9153264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CCTCC; GDC0283
CCTCC; GDC0284 CLS; 300265 DSMZ; ACC-256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007365
CLO; CLO_0037116 MCCL; MCC:0000290 CLDB; cl3243 cancercelllines; CVCL_0395 CCRID; 1101HUM-PUMC000040 DSMZCellDive; ACC-256 LINCS_LDP; LCL-1298 Lonza; 109 TOKU-E; 3599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307965
ChEMBL-Targets; CHEMBL612518 PharmacoDB; LNCAP_850_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q6459234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSE99795 GEO; GSM91927 GEO; GSM142457 GEO; GSM142458 GEO; GSM383948 GEO; GSM383953 GEO; GSM482669 GEO; GSM525800 GEO; GSM784790 GEO; GSM816637 GEO; GSM816634 GEO; GSM844579 GEO; GSM945240 GEO; GSM945282 GEO; GSM1022672 GEO; GSM1029460 GEO; GSM1029461 GEO; GSM1029462 GEO; GSM1029463 GEO; GSM1029464 GEO; GSM1029465 GEO; GSM1029466 GEO; GSM1029467 GEO; GSM1374622 GEO; GSM1374626 GEO; GSM2069518 GEO; GSM2069519 GEO; GSM2069520 GEO; GSM2069521 GEO; GSM2069522 GEO; GSM2069523 GEO; GSM2069524 GEO; GSM2069525 GEO; GSM2650017 GEO; GSM2650018 GEO; GSM2650019 GEO; GSM2650020 GEO; GSM2650021 GEO; GSM2650022 GEO; GSM3145720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 704848
Cosmic; 721368 Cosmic; 721555 Cosmic; 755298 Cosmic; 759895 Cosmic; 801348 Cosmic; 850413 Cosmic; 850745 Cosmic; 850821 Cosmic; 869155 Cosmic; 918500 Cosmic; 920967 Cosmic; 921047 Cosmic; 922553 Cosmic; 923955 Cosmic; 943176 Cosmic; 948076 Cosmic; 949248 Cosmic; 1028648 Cosmic; 1028701 Cosmic; 1066237 Cosmic; 1070886 Cosmic; 1071481 Cosmic; 1071906 Cosmic; 1075275 Cosmic; 1172626 Cosmic; 1176618 Cosmic; 1330909 Cosmic; 1556120 Cosmic; 1689708 Cosmic; 1995486 Cosmic; 2537792 Cosmic; 2580128 Cosmic; 2585151 Cosmic; 2585228 Cosmic; 2621168 Cosmic; 2651770 Cosmic; 2669169 Cosmic; 2816221 IARC_TP53; 21076 Progenetix; CVCL_0395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000953
PRIDE; PXD000985 PRIDE; PXD002107 PRIDE; PXD002395 PRIDE; PXD003105 PRIDE; PXD003262 PRIDE; PXD006561 PRIDE; PXD032264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |