Cellosaurus WiDr (CVCL_2760)
Cell line name | WiDr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | WiDR; WIDR; WiDr/S; WiDr-TC; WiDrTC; LED-WiDr; Led-WiDr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: WiDr (RRID:CVCL_2760) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a HT-29 derivative (PubMed=3472642; PubMed=20143388). Originally thought to originate from a 78 year old female patient with a primary adenocarcinoma of the rectosigmoid colon. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00103. Population: Caucasian. Doubling time: 15 hours (PubMed=90012); 18 hours (PubMed=9488600); 45.68 hours (PubMed=25944804). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10674020; PubMed=24042735; PubMed=25926053; PubMed=28683746). Omics: Deep exome analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: N-glycan profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0320 (HT-29) Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 44Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-218; CLS=300377; ECACC=85111501; JCRB=IFO50043; JCRB=JCRB0224; KCLB=10218; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4203458 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=90012; DOI=10.1007/BF02618407 CLPUB00271 PubMed=7118132; DOI=10.1007/BF02796478 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3472642; DOI=10.1016/0165-4608(87)90267-6 PubMed=3335022 PubMed=1657424; DOI=10.1007/BF00685821 PubMed=1389533; DOI=10.1016/0959-8049(92)90031-V PubMed=8464898; DOI=10.1073/pnas.90.7.2842; PMCID=PMC46192 PubMed=7874267; DOI=10.1007/BF02349278 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=9488600; DOI=10.1007/s002800050744 PubMed=10674020; DOI=10.1016/S0959-8049(99)00206-3 PubMed=10956384; DOI=10.1002/1097-0215(20000915)87:6<771::AID-IJC2>3.0.CO;2-V PubMed=11414198; DOI=10.1007/s004320000207 PubMed=16854228; DOI=10.1186/1476-4598-5-29; PMCID=PMC1550420 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=20570890; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-0192; PMCID=PMC2943514 PubMed=23932154; DOI=10.1016/j.radonc.2013.06.032 PubMed=24042735; DOI=10.1038/oncsis.2013.35; PMCID=PMC3816225 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=25944804; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-14-2457 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26537799; DOI=10.1074/mcp.M115.051235; PMCID=PMC4762531 PubMed=28683746; DOI=10.1186/s12943-017-0691-y; PMCID=PMC5498998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-218
BCRC; 60157 CLS; 300377 ECACC; 85111501 ICLC; HTL00003 JCRB; IFO50043 JCRB; JCRB0224 KCLB; 10218 NCI-DTP; WIDR RCB; RCB1908 - Discontinued TKG; TKG 0513 TKG; TKG 0516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009600
CLDB; cl4715 CLDB; cl4988 cancercelllines; CVCL_2760 Cell_Model_Passport; SIDM00152 ColonAtlas; WIDR FCS-free; 180-2-342-3-16-3 IGRhCellID; WIDR LINCS_HMS; 50049 LINCS_LDP; LCL-1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307674
ChEMBL-Targets; CHEMBL614647 PharmacoDB; WIDR_1660_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54994056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 GEO; GSM784020 GEO; GSM827327 GEO; GSM1006242 GEO; GSM1006243 GEO; GSM1006244 GEO; GSM1374987 GEO; GSM1374988 GEO; GSM1448091 GEO; GSM2550022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolomic databases | MetaboLights; MTBLS227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 738928
Cosmic; 887216 Cosmic; 897740 Cosmic; 905002 Cosmic; 1066213 Cosmic; 1122336 Cosmic; 1132695 Cosmic; 1184091 Cosmic; 1187326 Cosmic; 1218881 Cosmic; 1466826 Cosmic; 1479615 Cosmic; 1609498 Cosmic; 1676736 Cosmic; 2651871 Cosmic; 2664048 Cosmic; 2668255 Cosmic; 2760078 IARC_TP53; 21 Progenetix; CVCL_2760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |