Cellosaurus VCaP (CVCL_2235)
Cell line name | VCaP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | VCAP; Vcap; Vertebral Cancer of the Prostate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: VCaP (RRID:CVCL_2235) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Characteristics: Established from a xenograft produced by implantation of tumor cells in a SCID mouse. Virology: Contains an integrated xenotropic MuLV-related virus (XMRV) Bxv-1 (PubMed=21698104). Doubling time: 220 hours (PubMed=25984343); ~53 hours (ATCC=CRL-2876); ~51 hours (PBCF); 126.45 hours (GrayJW panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=23671654; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Prostate carcinoma (NCIt: C4863) Derived from metastatic site: Bone; vertebra. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_2025 ! DuCaP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ATCC; CCRID; CLS; Cosmic-CLP; ECACC; PubMed=14518029; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://en.wikipedia.org/wiki/VCaP https://www.phe-culturecollections.org.uk/media/161930/vcap-cell-line-profile-v2.pdf https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/atcc-crl-2876-growth-and-morphology https://www.synapse.org/#!Synapse:syn31544522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11317522 PubMed=14518029; DOI=10.1002/pros.10290 PubMed=14518030; DOI=10.1002/pros.10291 CLPUB00698 PubMed=21698104; DOI=10.1371/journal.pone.0020874 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=23447416; DOI=10.1002/path.4186 PubMed=23615946; DOI=10.1007/s00439-013-1308-1 PubMed=23671654; DOI=10.1371/journal.pone.0063056 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28145883; DOI=10.18632/oncotarget.14850 PubMed=30305041; DOI=10.1186/s12885-018-4848-x PubMed=30244336; DOI=10.1007/s00345-018-2501-6 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 PubMed=34402095; DOI=10.1002/pros.24210 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; C0019001/73
ATCC; CRL-2876 CLS; 300631 ECACC; 06020201 IZSLER; BS TCL 234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCRID; 3101HUMSCSP5034
CCRID; 3101HUMTCHu220 Cell_Model_Passport; SIDM01077 Cosmic-CLP; 1299075 DepMap; ACH-000115 LINCS_LDP; LCL-1147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473238
BioSample; SAMN05292448 BioSample; SAMN10988209 ENCODE; ENCBS316RCQ ENCODE; ENCBS626UQL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4295435
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296508 GDSC; 1299075 PharmacoDB; VCaP_1653_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q29511246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0007752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM525805 GEO; GSM648824 GEO; GSM887731 GEO; GSM888826 GEO; GSM1374984 GEO; GSM1440913 GEO; GSM1440914 GEO; GSM1633311 GEO; GSM1633312 GEO; GSM1633313 GEO; GSM1670571 GEO; GSM2069530 GEO; GSM2069531 GEO; GSM2069532 GEO; GSM2069533 GEO; GSM2069534 GEO; GSM2069535 GEO; GSM2069536 GEO; GSM2069537 GEO; GSM3145745 GEO; GSM3407124 GEO; GSM3407125 GEO; GSM3407126 GEO; GSM3407127 GEO; GSM3407128 GEO; GSM3407129 GEO; GSM5402196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1028646
Cosmic; 1028698 Cosmic; 1043330 Cosmic; 1071482 Cosmic; 1689710 Cosmic; 1995663 Cosmic; 2580131 IARC_TP53; 18891 LiGeA; CCLE_269 Progenetix; CVCL_2235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |