Cellosaurus CCRF-HSB-2 (CVCL_1859)
Cell line name | CCRF-HSB-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CCRF HSB-2; CCRF-HSB2; HSB-2; HSB.2; HSB2; H-SB2; SB-2; HSB; H.S.B.; GM04155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_5938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CCRF-HSB-2 (RRID:CVCL_1859) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Partially contaminated. The stock formerly distributed by CLS under catalog number 300214 was contaminated. Compared to the STR values obtained by other distributors it differed from having: Amelogenin: X; CSF1PO: 8,12; D16S539: 9,13,14; D18S51: 9,13,14; D21S11: 28,29; D7S820: 10,14; D8S1179: 9,15; FGA: 22,23,24; Penta D: 9; Penta E: 6,13 and TH01: 8,10. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Characteristics: Established by serial transplantation into newborn Syrian hamsters. Doubling time: 40 hours (PubMed=17117183); ~25 hours (DSMZ=ACC-435); 24 hours (Note=Lot 042091) (JCRB=JCRB0031). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=10739008; PubMed=11226526). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: CCRF-HBS-2; NCBI_Iran=C530. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_1860 ! CCRF-SB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 11Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-120.1; DSMZ=ACC-435; ECACC=85112801; JCRB=JCRB0031; KCLB=10120.1; RCB=RCB0016 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/BF02618370 PubMed=4991454; DOI=10.1016/0014-4827(79)90504-4 PubMed=4363409; DOI=10.1084/jem.139.5.1070; PMCID=PMC2139653 PubMed=4523807; DOI=10.1007/BF02616012 PubMed=168255; DOI=10.4049/jimmunol.115.1.243 PubMed=62390; DOI=10.1111/j.1365-3083.1976.tb03029.x PubMed=1086134 PubMed=6600440; DOI=10.1007/BF02617996 PubMed=6582512; DOI=10.1073/pnas.81.2.568; PMCID=PMC344720 PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=3495441; DOI=10.1002/eji.1830170503 PubMed=2140233; DOI=10.1111/j.1440-1827.1990.tb01549.x PubMed=2144611; DOI=10.1128/mcb.10.10.5502-5509.1990; PMCID=PMC361264 PubMed=2255914; DOI=10.1126/science.2255914 CLPUB00447 PubMed=8316623; DOI=10.2307/3578190 PubMed=7630190 PubMed=8547074; DOI=10.1111/j.1365-2141.1995.tb05302.x DOI=10.11418/jtca1981.15.4_211 PubMed=8558913 PubMed=8957066; DOI=10.1111/j.1349-7006.1996.tb03112.x; PMCID=PMC5920998 PubMed=9787181; DOI=10.1182/blood.V92.9.3410 PubMed=9933131; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00133-7 PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=14504097; DOI=10.1182/blood-2003-02-0418 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=15901131; DOI=10.1016/j.prp.2005.01.002 PubMed=17117183; DOI=10.1038/sj.bjc.6603447; PMCID=PMC2360743 PubMed=17170727; DOI=10.1038/sj.leu.2404486 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-120.1
BEI_Resources; ARP-497 CLS; 300214 - Discontinued Coriell; GM04155 DSMZ; ACC-435 ECACC; 85112801 IZSLER; BS TCL 185 JCRB; JCRB0031 KCLB; 10120.1 NCBI_Iran; C530 RCB; RCB0016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002335
CLO; CLO_0004258 CLO; CLO_0016177 CLO; CLO_0050971 CLDB; cl678 cancercelllines; CVCL_1859 Cell_Model_Passport; SIDM01558 DSMZCellDive; ACC-435 LINCS_LDP; LCL-1914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472334
BioSample; SAMN03472701 BioSample; SAMN03473542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307642
ChEMBL-Targets; CHEMBL614541 PubChem_Cell_line; CVCL_1859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54809037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM5137752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 683532
Cosmic; 801729 Cosmic; 850195 Cosmic; 913416 Cosmic; 922679 Cosmic; 932768 Cosmic; 996307 Cosmic; 998723 Cosmic; 1037688 Cosmic; 1115591 Cosmic; 1175128 Cosmic; 1226856 Cosmic; 1281369 Cosmic; 1330497 Cosmic; 1524797 Cosmic; 1641390 Cosmic; 1760523 Cosmic; 2165712 Cosmic; 2361365 Cosmic; 2458762 Cosmic; 2462861 Cosmic; 2602915 Cosmic; 2649236 IARC_TP53; 21649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |