Cellosaurus TF-1 (CVCL_0559)
Cell line name | TF-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | TF1; MFD-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: TF-1 (RRID:CVCL_0559) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Japanese. Characteristics: Proliferatively responsive to many growth factors. Characteristics: IL3 or CSF2 dependent. Doubling time: 39 +- 6 hours (PubMed=9096695); 22 hours (ATCC=CRL-2003); ~70 hours (DSMZ=ACC-334). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
Source: DSMZCellDive=ACC-334
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Erythroleukemia (NCIt: C7152) Acute erythroid leukemia (ORDO: Orphanet_318) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 35Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2003; CCRID; CLS=300434; DSMZ=ACC-334; ECACC=93022307; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=TF-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2656885; DOI=10.1002/stem.5530070202 PubMed=2663885; DOI=10.1002/jcp.1041400219 PubMed=1571549; DOI=10.1182/blood.V79.9.2378.2378 PubMed=9096695; DOI=10.1038/sj.leu.2400621 PubMed=9510473; DOI=10.1111/j.1349-7006.1998.tb00476.x; PMCID=PMC5921588 PubMed=11021758; DOI=10.1038/sj.leu.2401891 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11414198; DOI=10.1007/s004320000207 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23955599; DOI=10.1038/ng.2731 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2003
BCRC; 60323 BCRJ; 0233 - Discontinued CCTCC; GDC0196 CLS; 300434 DSMZ; ACC-334 ECACC; 93022307 ICLC; HTL05001 NCBI_Iran; C602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009325
CLO; CLO_0009326 MCCL; MCC:0000460 CLDB; cl4503 CLDB; cl7163 cancercelllines; CVCL_0559 CCRID; 1101HUM-PUMC000118 CCRID; 1102HUM-NIFDC00101 Cell_Model_Passport; SIDM01470 DepMap; ACH-000387 DSMZCellDive; ACC-334 LINCS_LDP; LCL-1077 Lonza; 1015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470850
BioSample; SAMN10988443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307972
ChEMBL-Targets; CHEMBL612552 GDSC; 1331044 PharmacoDB; TF1_1588_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54972197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM743414 GEO; GSM887704 GEO; GSM888797 GEO; GSM1374961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 787479
Cosmic; 919129 Cosmic; 924041 Cosmic; 975302 Cosmic; 1012123 Cosmic; 1127259 Cosmic; 1281355 Cosmic; 2089658 Cosmic; 2306240 IARC_TP53; 2197 LiGeA; CCLE_592 Progenetix; CVCL_0559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |