Cellosaurus G-401 (CVCL_0270)
Cell line name | G-401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | G401; G 401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: G-401 (RRID:CVCL_0270) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a Wilms tumor cell line but is a kidney rhabdoid tumor cell line (PubMed=8382007; PubMed=30924592). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Kidney; UBERON=UBERON_0002113. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Rhabdoid tumor of the kidney (NCIt: C8715) Rhabdoid tumor (ORDO: Orphanet_69077) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1441; CCRID=1101HUM-PUMC000034; Cosmic-CLP=907299; ECACC=87042204; JCRB=JCRB9065; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/g/cell-lines-detail-286.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8382007; PMCID=PMC1886739 PubMed=9671307; DOI=10.1038/28212 PubMed=10397258 PubMed=10602515; DOI=10.1038/sj.onc.1203168 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28945250; DOI=10.1038/ng.3958; PMCID=PMC5803080 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30924592; DOI=10.1002/pbc.27741 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1441
BCRJ; 0418 ECACC; 87042204 JCRB; JCRB9065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003434
MCCL; MCC:0000161 CLDB; cl1409 cancercelllines; CVCL_0270 CCRID; 1101HUM-PUMC000034 Cell_Model_Passport; SIDM00856 Cosmic-CLP; 907299 DepMap; ACH-000096 IGRhCellID; G401 LINCS_LDP; LCL-1511 TOKU-E; 1303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSR6XERO32
BioSample; SAMN03470969 BioSample; SAMN03472819 BioSample; SAMN10987919 ENCODE; ENCBS062JBT ENCODE; ENCBS432GBV ENCODE; ENCBS629BMK ENCODE; ENCBS659PBH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308394
ChEMBL-Targets; CHEMBL613509 GDSC; 907299 PharmacoDB; G401_374_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827165 GEO; GSM887017 GEO; GSM888086 GEO; GSM1669799 GEO; GSM1676299 GEO; GSM1701634 GEO; GSM2033123 GEO; GSM2033124 GEO; GSM2033125 GEO; GSM2033126 GEO; GSM2033127 GEO; GSM2033128 GEO; GSM2409659 GEO; GSM2409660 GEO; GSM2409661 GEO; GSM2409662 GEO; GSM2409663 GEO; GSM2495985 GEO; GSM2787352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 683682
Cosmic; 802044 Cosmic; 802245 Cosmic; 907299 IARC_TP53; 21334 LiGeA; CCLE_546 Progenetix; CVCL_0270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |