Cellosaurus GM06990 (CVCL_9587)
Cell line name | GM06990 | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | GM06990A; CEPH-1331-NA06990; 1331-8233 | ||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_9587 | ||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_G376 | ||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GM06990 (RRID:CVCL_9587) | ||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: CEPH/Utah pedigree cell line collection. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: International Histocompatibility Workshop cell lines. Registration: CEPH Families Reference Panel; 133102. Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: CTCF ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: B-cell; CL=CL_0000236. | ||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: IPD-IMGT/HLA=25804
| ||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 41Y | ||||||||||||||||||||||||
Category | Transformed cell line | ||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=11416159 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cephb.fr/en/familles_CEPH.php | ||||||||||||||||||||||||
Publications | CLPUB00447 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=20856902; DOI=10.1371/journal.pbio.1000480; PMCID=PMC2939022 PubMed=23861383; DOI=10.1101/gr.155218.113; PMCID=PMC3814878 | ||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | Coriell; GM06990 | ||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0036556
dbMHC; 48538 IHW; IHW01003 IPD-IMGT/HLA; 25804 | ||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN00004982
ENCODE; ENCBS057ENC ENCODE; ENCBS058ENC ENCODE; ENCBS059ENC ENCODE; ENCBS060ENC ENCODE; ENCBS061ENC ENCODE; ENCBS062ENC ENCODE; ENCBS063ENC ENCODE; ENCBS064ENC ENCODE; ENCBS146QHV ENCODE; ENCBS177AAA ENCODE; ENCBS185XLT ENCODE; ENCBS414HDG ENCODE; ENCBS875KTK ENCODE; ENCBS987SKT | ||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54842431 | ||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002783 | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSE38809
GEO; GSM207754 GEO; GSM420468 GEO; GSM472903 GEO; GSM472904 GEO; GSM660029 GEO; GSM660236 GEO; GSM660440 GEO; GSM736558 GEO; GSM736635 GEO; GSM749705 GEO; GSM749708 GEO; GSM749731 GEO; GSM827333 GEO; GSM905817 GEO; GSM905912 GEO; GSM906007 GEO; GSM923443 GEO; GSM931323 GEO; GSM931324 GEO; GSM945179 GEO; GSM945205 GEO; GSM945213 GEO; GSM945237 | ||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |