Cellosaurus ECC-1 (CVCL_7260)
Cell line name | ECC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | ECC1; EnCa1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_7260 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: ECC-1 (RRID:CVCL_7260) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a Ishikawa 3-H-12 derivative (PubMed=22710073). Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00460. Population: Japanese. Omics: Array-based CGH. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Endometrium; UBERON=UBERON_0001295. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Disease | Endometrial adenocarcinoma (NCIt: C7359) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_D199 (Ishikawa 3-H-12) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 39Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2923; PubMed=22710073; PubMed=25877200; PubMed=33174010 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/ECC1_Myers_protocol.pdf https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10478797; DOI=10.1007/s11626-999-0025-5 PubMed=16707768; DOI=10.1095/biolreprod.106.051870 PubMed=20218740; DOI=10.1177/153303461000900207; PMCID=PMC5120669 PubMed=22710073; DOI=10.1016/j.ygyno.2012.06.017; PMCID=PMC3432677 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112; PMCID=PMC3589544 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=33174010; DOI=10.3892/ijo.2020.5139; PMCID=PMC8811471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2923 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037231
cancercelllines; CVCL_7260 Lonza; 1319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151801
BioSample; SAMN03472871 ENCODE; ENCBS034DOC ENCODE; ENCBS159ITB ENCODE; ENCBS222DWG ENCODE; ENCBS312UTV ENCODE; ENCBS336PJO ENCODE; ENCBS347ANJ ENCODE; ENCBS624SHM ENCODE; ENCBS670ZEX ENCODE; ENCBS731RSG ENCODE; ENCBS743VIZ ENCODE; ENCBS758FSP ENCODE; ENCBS767JJY ENCODE; ENCBS862NRL ENCODE; ENCBS896YZO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54831921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM843495
GEO; GSM843496 GEO; GSM923422 GEO; GSM923423 GEO; GSM923426 GEO; GSM923427 GEO; GSM1008597 GEO; GSM1008574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1102375
Cosmic; 1576451 Cosmic; 1622895 Cosmic; 2030461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |