Cellosaurus SW527 (CVCL_3799)
Cell line name | SW527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-527; SW 527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW527 (RRID:CVCL_3799) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a SW480 derivative (PubMed=288927; PubMed=20143388). Originally thought to originate from a 70 year old female patient with a metastatic breast carcinoma. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00089. Population: Caucasian. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0546 (SW480) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 51Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-7940; DepMap=ACH-001825; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://dpsc.ccbr.utoronto.ca/cancer/get_cellline.pl?cellline=SW527 https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=288927; DOI=10.1093/jnci/63.3.635 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=22585861; DOI=10.1158/2159-8290.CD-11-0224; PMCID=PMC5057396 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25892236; DOI=10.1016/j.celrep.2015.03.050; PMCID=PMC4425736 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-7940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009219
cancercelllines; CVCL_3799 DepMap; ACH-001825 LINCS_HMS; 50046 LINCS_LDP; LCL-1474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151930
BioSample; SAMN03481115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SW527_1526_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1047713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD008222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |