Cellosaurus SW579 (CVCL_3603)
Cell line name | SW579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-579; SW 579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW579 (RRID:CVCL_3603) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: KuDOS 95 cell line panel. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Omics: Deep exome analysis. Omics: Mitochondrial genome sequenced. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Thyroid gland; UBERON=UBERON_0002046. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Thyroid gland squamous cell carcinoma (NCIt: C46008) Thyroid carcinoma (ORDO: Orphanet_100088) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-107; CCRID; CLS=300346; IZSLER=BS TCL 121 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6220172 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=1516062 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50007-1 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29066502; DOI=10.1530/ERC-17-0288 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31443247; DOI=10.3390/cancers11081185; PMCID=PMC6721552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-107
BCRC; 60412 CLS; 300346 IZSLER; BS TCL 121 KCB; KCB 2013004YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009220
cancercelllines; CVCL_3603 CCRID; 1101HUM-PUMC000264 CCRID; 3101HUMTCHu125 Cell_Model_Passport; SIDM01167 DepMap; ACH-000163 IGRhCellID; SW579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10988339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SW579_1540_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887676 GEO; GSM888768 GEO; GSM1374931 GEO; GSM1374932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1005454
Cosmic; 1006467 Cosmic; 1017791 Cosmic; 1041672 Cosmic; 1094773 Cosmic; 1339924 IARC_TP53; 1308 LiGeA; CCLE_771 Progenetix; CVCL_3603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |