Cellosaurus CGTH-W-1 (CVCL_1120)
Cell line name | CGTH-W-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CGTH-W1; CGTH W-1; CGTHW1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CGTH-W-1 (RRID:CVCL_1120) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a SW579 derivative (PubMed=25877200; DSMZ). Originally thought to originate from a thyroid gland follicular carcinoma metastasizing to the sternum of a 70 year old Chinese female patient. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00536. Population: Caucasian. Doubling time: ~18 hours (PubMed=8888804); ~20-25 hours (DSMZ=ACC-360). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Thyroid gland; UBERON=UBERON_0002046. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Thyroid gland squamous cell carcinoma (NCIt: C46008) Thyroid carcinoma (ORDO: Orphanet_100088) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_3603 (SW579) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910568; DSMZ=ACC-360; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8826082; DOI=10.1007/BF02634562 PubMed=8888804; DOI=10.1002/(SICI)1096-9098(199610)63:2<112::AID-JSO8>3.0.CO;2-H PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23833040; DOI=10.1210/jc.2013-2383; PMCID=PMC3763971 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-360 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002406
cancercelllines; CVCL_1120 Cell_Model_Passport; SIDM01248 Cosmic-CLP; 910568 DepMap; ACH-001023 DSMZCellDive; ACC-360 IGRhCellID; CGTHW1 LINCS_LDP; LCL-1691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470999
BioSample; SAMN03473318 BioSample; SAMN10987694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308849
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366300 GDSC; 910568 PharmacoDB; CGTHW1_194_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54811588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM886926 GEO; GSM887992 GEO; GSM1669673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910568
Cosmic; 1995365 Cosmic; 2054098 IARC_TP53; 21223 Progenetix; CVCL_1120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |