Cellosaurus SKN (CVCL_3167)
Cell line name | SKN | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_3167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SKN (RRID:CVCL_3167) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 36 hours (Note=At 29th passage) (PubMed=556976). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Uterine corpus leiomyosarcoma (NCIt: C6340) Leiomyosarcoma of the corpus uteri (ORDO: Orphanet_213625) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1240215; DepMap=ACH-001655; JCRB=IFO50314; JCRB=JCRB0173; RCB=RCB0513 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=556976 PubMed=2429643; DOI=10.1111/j.1447-0756.1986.tb00192.x PubMed=2448191; DOI=10.1016/0090-8258(88)90151-5 CLPUB00481 PubMed=9436037 PubMed=9573483 PubMed=10457904 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; IFO50314
JCRB; JCRB0173 JCRB; FDSC0031 - Discontinued RCB; RCB0513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050881
cancercelllines; CVCL_3167 Cell_Model_Passport; SIDM00377 Cosmic-CLP; 1240215 DepMap; ACH-001655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470820
BioSample; SAMN03472277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1240215
PharmacoDB; SKN_1419_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54954754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSM827211 GEO; GSM1670447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1330908
Progenetix; CVCL_3167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |