Cellosaurus C-4-I (CVCL_2253)
Cell line name | C-4-I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | C-4I; C-4 I; C-4-i; C4-I; C4-1; C4 I; C4I; C41; Hs 636.T; Hs 636 T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: C-4-I (RRID:CVCL_2253) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Virology: Contains a complete HPV18 genome. Doubling time: 2 days (PubMed=29156801). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003; Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 333761; Human papillomavirus type 18 (HPV18). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Uterus, cervix; UBERON=UBERON_0000002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=77569
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Human papillomavirus-related cervical squamous cell carcinoma (NCIt: C27676) Squamous cell carcinoma of the cervix uteri (ORDO: Orphanet_213767) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1095 ! C-4-II | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 41Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1594; Cosmic-CLP=687506; DepMap=ACH-001334; PubMed=29156801 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=13863218; DOI=10.1093/jnci/28.3.605 PubMed=14114965; DOI=10.1093/jnci/32.1.135 PubMed=5796380; DOI=10.1093/jnci/43.1.151 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=560251 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=77569; DOI=10.1111/j.1399-0039.1978.tb01259.x PubMed=6935474; DOI=10.1093/jnci/66.2.239 PubMed=7459858 PubMed=2983228; DOI=10.1038/314111a0 PubMed=2990217; PMCID=PMC1888002 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3029760; DOI=10.1073/pnas.84.4.1070; PMCID=PMC304363 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=15531914; DOI=10.1038/sj.onc.1208235 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29156801; DOI=10.18632/oncotarget.21174; PMCID=PMC5689691 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35692560; DOI=10.1080/23723556.2022.2078628; PMCID=PMC9176225 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1594
ATCC; CRL-7396 - Discontinued ECACC; 89051702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002125
CLO; CLO_0002129 CLDB; cl521 cancercelllines; CVCL_2253 Cell_Model_Passport; SIDM00905 Cosmic-CLP; 687506 DepMap; ACH-001334 IGRhCellID; C4I LINCS_LDP; LCL-1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 687506
PharmacoDB; C4I_151_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54799744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM113860 GEO; GSM253295 GEO; GSM675731 GEO; GSM685438 GEO; GSM1669639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687506
Cosmic; 925358 Cosmic; 928906 Cosmic; 877471 Cosmic; 1019308 Cosmic; 1131518 Cosmic; 1193035 Cosmic; 1201771 Cosmic; 2646656 Cosmic; 2660189 Cosmic; 2816213 Progenetix; CVCL_2253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |