Cellosaurus SK-GT-4 (CVCL_2195)
Cell line name | SK-GT-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SKGT4; SK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SK-GT-4 (RRID:CVCL_2195) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Population: Caucasian. Doubling time: 39 hours (PubMed=8334620); ~30-35 hours (DSMZ=ACC-712). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Caution: TP53 mutation indicated incorrectly as being at p.Arg175His (c.524G>A) in PubMed=7665247. Misspelling: SJGT4; GEO=GSM337727. Derived from site: In situ; Esophagus, distal; UBERON=UBERON_0013473. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal adenocarcinoma (NCIt: C4025) Adenocarcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99976) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 89Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1503365; DepMap=ACH-001654; DSMZ=ACC-712; PubMed=20075370 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8334620; DOI=10.1002/1097-0142(19930801)72:3<649::AID-CNCR2820720305>3.0.CO;2-L PubMed=7665247; DOI=10.1002/ijc.2910640109 PubMed=11520067; DOI=10.1006/bbrc.2001.5400 PubMed=20075370; DOI=10.1093/jnci/djp499; PMCID=PMC2902814 PubMed=20139130; DOI=10.1093/carcin/bgq036 PubMed=23795680; DOI=10.1111/dote.12095 PubMed=26317542; DOI=10.18632/oncotarget.4540; PMCID=PMC4694873 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=27594985; DOI=10.12688/f1000research.7033.1; PMCID=PMC4991527 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-712
ECACC; 11012007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_2195
Cell_Model_Passport; SIDM00483 Cosmic-CLP; 1503365 DepMap; ACH-001654 DSMZCellDive; ACC-712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1503365
PharmacoDB; SKGT4_1389_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54953662 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0001237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSE2144 GEO; GSE13376 GEO; GSM1374878 GEO; GSM1670431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1599346
IARC_TP53; 4079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |