Cellosaurus MT-3 [Human contaminated breast cancer] (CVCL_2129)
Cell line name | MT-3 [Human contaminated breast cancer] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | MT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MT-3 [Human contaminated breast cancer] (RRID:CVCL_2129) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a LS174T derivative (PubMed=25877200; DSMZ). Originally thought to originate from a breast carcinoma. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00506. Population: Caucasian. Doubling time: 37.1 +- 8.1 hours (PubMed=9150904); ~30 hours (DSMZ=ACC-403). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=12661003; PubMed=15677628). Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. Cell type: Epithelial cell of colon; CL=CL_0011108. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_1384 (LS174T) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-403; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cellosaurus.org/pawefish/BreastCellLineDescriptions/MT-3.html https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1446057; DOI=10.1007/BF01831480 PubMed=9150904; DOI=10.1023/A:1005756632293 PubMed=11044355; DOI=10.1054/bjoc.2000.1458; PMCID=PMC2408781 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=12800145; DOI=10.1002/gcc.10218 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-403 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007890
cancercelllines; CVCL_2129 DSMZCellDive; ACC-403 IGRhCellID; MT3 LINCS_HMS; 50031 LINCS_LDP; LCL-1473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472975
BioSample; SAMN03473582 BioSample; SAMN06481118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; MT3_969_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54906937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 GEO; GSM115102 GEO; GSM217592 GEO; GSM412073 GEO; GSM412084 GEO; GSM412093 GEO; GSM412098 GEO; GSM412106 GEO; GSM412110 GEO; GSM459700 GEO; GSM474280 GEO; GSM474281 GEO; GSM476484 GEO; GSM476485 GEO; GSM478311 GEO; GSM478312 GEO; GSM478314 GEO; GSM478315 GEO; GSM478320 GEO; GSM478321 GEO; GSM783977 GEO; GSM847419 GEO; GSM847498 GEO; GSM844610 GEO; GSM1172986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Progenetix; CVCL_2129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |