Cellosaurus CX-1 (CVCL_2011)
Cell line name | CX-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HT-29/CX-1; CX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CX-1 (RRID:CVCL_2011) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~24 hours (CLS=300159); ~30 hours (DSMZ=ACC-129). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=24755471; PubMed=25926053). Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0320 (HT-29) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 44Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CLS=300159; DSMZ=ACC-129; PubMed=25877200; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7651727 PubMed=10737795; DOI=10.1073/pnas.97.7.3352; PMCID=PMC16243 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=12601555; DOI=10.1007/s100380300014 PubMed=16418264; DOI=10.1073/pnas.0510146103; PMCID=PMC1327731 PubMed=20606684; DOI=10.1038/sj.bjc.6605780; PMCID=PMC2920028 PubMed=24755471; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-0013 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 300159
DSMZ; ACC-129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002650
CLDB; cl939 cancercelllines; CVCL_2011 ColonAtlas; CX1 DSMZCellDive; ACC-129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307403
ChEMBL-Targets; CHEMBL614566 PharmacoDB; CX1_270_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54817065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM206466 GEO; GSM274761 GEO; GSM274762 GEO; GSM1346835 GEO; GSM1448120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 948826
Cosmic; 995389 Cosmic; 1043809 Cosmic; 1374637 Cosmic; 2301971 Cosmic; 2800584 IARC_TP53; 4561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |