Cellosaurus COLO 699 (CVCL_1992)
Cell line name | COLO 699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | COLO-699; Colo-699; COLO #699; Colo699; COLO699; Colorado 699; CHL1DM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: COLO 699 (RRID:CVCL_1992) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a CHL-1 (or RPMI-7932) derivative (DSMZ=ACC-196; DepMap=ACH-001041). Originally thought to originate from the pleural effusion of a 57 year old female patient with lung adenocarcinoma. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Doubling time: ~38 hours (DSMZ=ACC-196). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Melanoma (NCIt: C3224) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_1122 (CHL-1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 36Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-196; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10908148; DOI=10.1038/labinvest.3780108 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26361996; DOI=10.1016/j.jprot.2015.09.003 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-196 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002574
CLDB; cl868 cancercelllines; CVCL_1992 Cell_Model_Passport; SIDM00911 DepMap; ACH-001041 DSMZCellDive; ACC-196 IGRhCellID; COLO699GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473074
BioSample; SAMN10989575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; COLO699_230_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM434300 GEO; GSM886946 GEO; GSM888014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 844591
Cosmic; 877394 Cosmic; 1028946 Cosmic; 1146950 Cosmic; 1152489 Progenetix; CVCL_1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD002556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |