Cellosaurus VA-ES-BJ (CVCL_1785)
Cell line name | VA-ES-BJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | VAESBJ; Valhalla-Epithelioid Sarcoma-BJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: VA-ES-BJ (RRID:CVCL_1785) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 36-39 hours (PubMed=21552805); ~32 hours (PubMed=21357725); ~60-90 hours (DSMZ=ACC-328). Karyotypic information: Near triploid karyotype. Trisomy of chromosomes 2, 5, 8, 10, 12, 13, 16, 17, 18 and 19, tetrasomy of chromosomes 6, 20 and 21 and pentasomy of chromosome 7 (PubMed=21552805). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Epithelioid sarcoma (NCIt: C3714) Epithelioid sarcoma (ORDO: Orphanet_293202) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 41Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2138; Cosmic-CLP=688121; DepMap=ACH-001702; DSMZ=ACC-328; ECACC=94092303; ICLC=HTL97024 Markers:
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Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=21552805; DOI=10.3892/ijo.7.1.51 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=21357725; DOI=10.1634/theoncologist.2010-0174; PMCID=PMC3228127 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=26365879; DOI=10.1002/path.4636 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=28945250; DOI=10.1038/ng.3958; PMCID=PMC5803080 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2138
DSMZ; ACC-328 ECACC; 94092303 ICLC; HTL97024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009509
CLDB; cl4635 CLDB; cl4636 Cell_Model_Passport; SIDM01179 Cosmic-CLP; 688121 DepMap; ACH-001702 DSMZCellDive; ACC-328 LINCS_LDP; LCL-1945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308888
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366259 GDSC; 688121 PharmacoDB; VAESBJ_1651_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54992642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1632462 GEO; GSM1632463 GEO; GSM1632464 GEO; GSM1632465 GEO; GSM1670569 GEO; GSM1676344 GEO; GSM1701675 GEO; GSM2409694 GEO; GSM2409695 GEO; GSM2409696 GEO; GSM2409697 GEO; GSM2409698 GEO; GSM2409699 GEO; GSM2787358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688121
IARC_TP53; 21268 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |