Cellosaurus SKG-IIIa (CVCL_1704)
Cell line name | SKG-IIIa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SKG-IIIA; SKG IIIa; SKGIIIA; SKG-3a; SKG3A; SKG3a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SKG-IIIa (RRID:CVCL_1704) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 333760; Human papillomavirus type 16 (HPV16). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Uterus, cervix; UBERON=UBERON_0000002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Human papillomavirus-related cervical squamous cell carcinoma (NCIt: C27676) Squamous cell carcinoma of the cervix uteri (ORDO: Orphanet_213767) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_2795 ! SKG-IIIb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 38Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=930298; JCRB=IFO50310; JCRB=JCRB0232; PubMed=25877200; RCB=RCB1892; TKG=TKG 0462 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6600963 PubMed=6699456 PubMed=8380785; DOI=10.1006/gyno.1993.1016 CLPUB00481 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=15099960; DOI=10.1016/j.ygyno.2004.02.012 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35692560; DOI=10.1080/23723556.2022.2078628; PMCID=PMC9176225 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; IFO50310
JCRB; JCRB0232 RCB; RCB1892 TKG; TKG 0462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050923
cancercelllines; CVCL_1704 Cell_Model_Passport; SIDM00381 Cosmic-CLP; 930298 DepMap; ACH-002020 LINCS_LDP; LCL-1804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821739
BioSample; SAMN03470894 BioSample; SAMN03471660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308786
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075581 GDSC; 930298 PharmacoDB; SKGIIIa_1417_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54954734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1670429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 877461
Cosmic; 930298 Cosmic; 1152539 Cosmic; 1995630 IARC_TP53; 27576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |