Cellosaurus SAS (CVCL_1675)
Cell line name | SAS | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_1675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SAS (RRID:CVCL_1675) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 33 hours (PubMed=24627082); ~30 hours (Note=Lot 07312007), ~21 hours (Note=Lot 08022016) (JCRB=JCRB0260). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Oral cavity, tongue; UBERON=UBERON_0001723. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=9178645
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Tongue squamous cell carcinoma (NCIt: C4648) Squamous cell carcinoma of the oral tongue (ORDO: Orphanet_457252) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 69Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=909708; DepMap=ACH-002029; JCRB=JCRB0260; RCB=RCB1974; TKG=TKG 0470 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.11277/stomatology1952.38.20 PubMed=9023415; DOI=10.1006/cimm.1996.1062 PubMed=9178645; DOI=10.1006/cimm.1997.1108 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D DOI=10.5843/jsot.13.Suppliment_301 PubMed=17325662; DOI=10.1038/sj.onc.1210330 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=24627082; DOI=10.3892/ijo.2014.2332 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=32990596; DOI=10.7554/eLife.57761; PMCID=PMC7591259 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0260
RCB; RCB1974 TKG; TKG 0470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0051568
cancercelllines; CVCL_1675 Cell_Model_Passport; SIDM00351 Cosmic-CLP; 909708 DepMap; ACH-002029 LINCS_LDP; LCL-1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471668
BioSample; SAMN03472049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308781
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075569 GDSC; 909708 PharmacoDB; SAS_1345_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827230 GEO; GSM850387 GEO; GSM950309 GEO; GSM950310 GEO; GSM950311 GEO; GSM950312 GEO; GSM1670402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 909708
Cosmic; 1042300 Cosmic; 1118787 Cosmic; 1120705 Cosmic; 1571803 Cosmic; 2546833 IARC_TP53; 23803 Progenetix; CVCL_1675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |