Cellosaurus OCI-AML-2 (CVCL_1619)
Cell line name | OCI-AML-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OCI/AML-2; OCIAML-2; OCI-AML2; OCI/AML2; OCI AML2; OCIAML2; AML-2; Ontario Cancer Institute-Acute Myeloid Leukemia-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OCI-AML-2 (RRID:CVCL_1619) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 30 hours (PubMed=25984343); ~30-50 hours (DSMZ=ACC-99). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: CTCF ChIP-seq epigenome analysis. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Hi-C chromosome conformation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute myeloid leukemia (NCIt: C9154) Acute myeloid leukemia with t(6;11)(q27;q23) KMT2A-MLLT4 (NCIt: C132105) Acute myeloid leukemia (ORDO: Orphanet_519) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 65Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910947; DSMZ=ACC-99; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2538684 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=15843827; DOI=10.1038/sj.leu.2403749 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRJ; 0383
DSMZ; ACC-99 ICLC; HTL01010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008235
CLDB; cl3760 CLDB; cl7059 cancercelllines; CVCL_1619 Cell_Model_Passport; SIDM00446 Cosmic-CLP; 910947 DepMap; ACH-000113 DSMZCellDive; ACC-99 LINCS_LDP; LCL-1065 Lonza; 327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473106
BioSample; SAMN10988499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308300
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366220 GDSC; 910947 PharmacoDB; OCIAML2_1183_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM482511 GEO; GSM887468 GEO; GSM888548 GEO; GSM1374780 GEO; GSM1446749 GEO; GSM1670295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 787466
Cosmic; 910947 Cosmic; 975288 Cosmic; 1012109 Cosmic; 1281344 Cosmic; 1319545 Cosmic; 1582386 Cosmic; 2131551 Cosmic; 2306231 Cosmic; 2750868 IARC_TP53; 21598 LiGeA; CCLE_626 Progenetix; CVCL_1619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 EGA; EGAS00001004741 EGA; EGAS00001004743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 44 |