Cellosaurus Mel Ho (CVCL_1402)
Cell line name | Mel Ho | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MEL HO; MEL-HO; MEL-Ho; Mel-HO; MelHo; MELHO; Ho | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Mel Ho (RRID:CVCL_1402) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misidentified/contaminated. Shown to be identical to MEL-Wei. This cell line was reported to be isogenic with LCL-Ho (Cellosaurus=CVCL_1868) but it does not have the same STR profile (PubMed=10508494; PubMed=20143388). According to DSMZ ACC-62 it is a human female cell line. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00144. Population: Caucasian. Doubling time: ~24 hours (DSMZ=ACC-62). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Skin; UBERON=UBERON_0002097. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Melanoma (NCIt: C3224) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_3981 ! Mel Wei | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=908124; DSMZ=ACC-62; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6895502; DOI=10.1002/eji.1830111015 PubMed=10508494; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<555::AID-IJC19>3.0.CO;2-2 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22170099; DOI=10.1038/cddis.2011.129; PMCID=PMC3252738 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007675
CLDB; cl3439 cancercelllines; CVCL_1402 Cell_Model_Passport; SIDM00337 Cosmic-CLP; 908124 DepMap; ACH-000450 DSMZCellDive; ACC-62 LINCS_LDP; LCL-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03152032
BioSample; SAMN03473130 BioSample; SAMN03473505 BioSample; SAMN10988268 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308798
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075500 GDSC; 908124 PharmacoDB; MELHO_914_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54905059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887308 GEO; GSM888384 GEO; GSM1670094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 908124
Cosmic; 1995504 IARC_TP53; 21492 LiGeA; CCLE_006 Progenetix; CVCL_1402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |