Cellosaurus HCC4006 (CVCL_1269)
Cell line name | HCC4006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-4006; Hamon Cancer Center 4006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC4006 (RRID:CVCL_1269) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: EGFR genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1027). Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Doubling time: 46.8 hours (PubMed=29681454). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) Derived from metastatic site: Pleural effusion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | >50Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ATCC; PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=16187286; DOI=10.1002/ijc.21491 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112 PubMed=23733853; DOI=10.1101/gr.152322.112 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=26361996; DOI=10.1016/j.jprot.2015.09.003 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; C0016012/4917
ATCC; CRL-2871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003657
Cell_Model_Passport; SIDM01596 DepMap; ACH-000066 IGRhCellID; HCC4006GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471807
BioSample; SAMN03473288 BioSample; SAMN10988526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523544
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523575 PharmacoDB; HCC4006_502_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM63351 GEO; GSM253408 GEO; GSM434286 GEO; GSM794399 GEO; GSM844552 GEO; GSM887055 GEO; GSM888125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 903602
Cosmic; 1028938 Cosmic; 1128250 Cosmic; 1146936 Cosmic; 1802302 Cosmic; 2015233 IARC_TP53; 30035 LiGeA; CCLE_139 Progenetix; CVCL_1269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD002556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |