Cellosaurus C-33 A (CVCL_1094)
Cell line name | C-33 A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | C33A; C33a; C33-A; C-33-A; C-33A; C33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: C-33 A (RRID:CVCL_1094) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: PTEN genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1030). Population: Caucasian. Doubling time: 1.36 days (PubMed=29156801). Microsatellite instability: Instable (MSI-high) (PubMed=31068700; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: Secretome proteome analysis by 2D-DE/MS. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Uterus, cervix; UBERON=UBERON_0000002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Human papillomavirus-independent cervical squamous cell carcinoma (NCIt: C180841) Squamous cell carcinoma of the cervix uteri (ORDO: Orphanet_213767) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1E27 ! C-33 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 66Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0008003/382; ATCC=HTB-31; CCRID; Cosmic-CLP=687505; DepMap=ACH-001333; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/c/cell-lines-detail-23.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=14114965; DOI=10.1093/jnci/32.1.135 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6935474; DOI=10.1093/jnci/66.2.239 PubMed=7459858 PubMed=2990217; PMCID=PMC1888002 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=1648218; DOI=10.1073/pnas.88.13.5523; PMCID=PMC51909 PubMed=15531914; DOI=10.1038/sj.onc.1208235 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=24134916; DOI=10.1186/1755-8166-6-44; PMCID=PMC3879223 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28261610; DOI=10.1155/2017/4180703; PMCID=PMC5316418 PubMed=29156801; DOI=10.18632/oncotarget.21174; PMCID=PMC5689691 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35692560; DOI=10.1080/23723556.2022.2078628; PMCID=PMC9176225 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0008003/382
ATCC; HTB-31 ATCC; CRM-HTB-31 BCRC; 60554 BCRJ; 0348 CCTCC; GDC0144 CLS; 305072 ICLC; HTL02004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002115
CLDB; cl7126 cancercelllines; CVCL_1094 CCRID; 1101HUM-PUMC000172 CCRID; 1102HUM-NIFDC00091 CCRID; 3101HUMTCHu176 CCRID; 4201HUM-CCTCC00144 Cell_Model_Passport; SIDM00889 Cosmic-CLP; 687505 DepMap; ACH-001333 IGRhCellID; C33A LINCS_LDP; LCL-1300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473073 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308230
ChEMBL-Targets; CHEMBL614370 ChEMBL-Targets; CHEMBL2366313 GDSC; 687505 PharmacoDB; C33A_150_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54799738 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM253296 GEO; GSM675730 GEO; GSM685441 GEO; GSM1669637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687505
Cosmic; 760217 Cosmic; 809226 Cosmic; 846180 Cosmic; 877470 Cosmic; 925355 Cosmic; 928905 Cosmic; 1071910 Cosmic; 1131520 Cosmic; 1176610 Cosmic; 1193030 Cosmic; 1201776 Cosmic; 1324210 Cosmic; 1995353 Cosmic; 2301537 Cosmic; 2602729 Cosmic; 2660188 Cosmic; 2791020 Cosmic; 2816218 IARC_TP53; 324 Progenetix; CVCL_1094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 48 |