Cellosaurus MDA-MB-435S (CVCL_0622)
Cell line name | MDA-MB-435S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MDA-MB-435s; MDA-MB-435 S; MDA-MB-435-S; MDAMB435S; BrCL15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MDA-MB-435S (RRID:CVCL_0622) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Parent cell line (MDA-MB-435) has been shown to be a M14 derivative. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: KuDOS 95 cell line panel. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00565. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Right buttock, hypodermis; UBERON=UBERON_0013691+UBERON_0002072. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Amelanotic melanoma (NCIt: C3802) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0417 (MDA-MB-435) Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 33Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-129; CCRID; CLS=300277; PubMed=28940260 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/atcc-htb-129-derivative https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/atcc-htb-129-vs-mda-mb-435 https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2007622; DOI=10.1083/jcb.113.1.173; PMCID=PMC2288921 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50009-5 PubMed=10700188; DOI=10.1038/73536 PubMed=12354931; DOI=10.1136/mp.55.5.294; PMCID=PMC1187258 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=16397213; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-05-2853 PubMed=16541312; DOI=10.1007/s10549-006-9186-z PubMed=19593635; DOI=10.1007/s10549-009-0460-8 PubMed=20070913; DOI=10.1186/1471-2407-10-15; PMCID=PMC2836299 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23601657; DOI=10.1186/bcr3415; PMCID=PMC3672661 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28940260; DOI=10.1002/ijc.31067; PMCID=PMC5762610 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-129
BCRJ; 0165 CCTCC; GDC0053 CLS; 300277 - Discontinued ICLC; HTL03006 KCB; KCB 200773YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007638
CLDB; cl7142 cancercelllines; CVCL_0622 CCRID; 1101HUM-PUMC000015 CCRID; 3101HUMTCHu36 Cell_Model_Passport; SIDM01222 DepMap; ACH-000884 LINCS_HMS; 50030 LINCS_LDP; LCL-1307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10987989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4483174
ChEMBL-Targets; CHEMBL4483284 PubChem_Cell_line; CVCL_0622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54904637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM149983 GEO; GSM149991 GEO; GSM149999 GEO; GSM421877 GEO; GSM887298 GEO; GSM888373 GEO; GSM1374657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 809237
Cosmic; 871155 Cosmic; 894089 Cosmic; 904381 Cosmic; 1044202 Cosmic; 1046951 Cosmic; 1287922 Cosmic; 1289399 Cosmic; 1523969 Cosmic; 1609477 Cosmic; 2301531 LiGeA; CCLE_408 Progenetix; CVCL_0622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD016837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |