Cellosaurus LA-N-5 (CVCL_0389)
Cell line name | LA-N-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | LAN-5; Lan-5; LAN5; Lan5; NBLAN5T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LA-N-5 (RRID:CVCL_0389) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Doubling time: ~100 hours (DSMZ=ACC-673). Omics: Array-based CGH. Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Miscellaneous: On the basis that LA-350 (Cellosaurus=CVCL_AR50) and LA-N-5 are both established by Seeger R.C., that they share identical STR profiles and that LA-350 is said to originate from a patient suffering from neuroblastoma we have annotated them as being autologous cell lines. Misspelling: LAN-3; Cosmic=920242. Derived from site: Metastatic; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_AR50 ! LA-350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 4M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): COG; DSMZ=ACC-673; RCB=RCB0485 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cccells.org/dl/NB_Data_Sheets/LA-N-5_Cell_Line_Data_Sheet_COGcell_org.pdf https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/l/cell-lines-detail-481.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6172518; DOI=10.4049/jimmunol.128.2.983 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=18082704; DOI=10.1016/j.jpedsurg.2007.08.026 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=18923524; DOI=10.1038/nature07399 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20655465; DOI=10.1016/j.cell.2010.06.004; PMCID=PMC2913027 PubMed=22213050; DOI=10.1002/ijc.27415; PMCID=PMC3757132 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493; PMCID=PMC3557959 PubMed=24466371; DOI=10.1593/tlo.13544; PMCID=PMC3890703 PubMed=24792489; DOI=10.1007/s11060-014-1456-8 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-673
ICLC; HTL96022 - Discontinued NCBI_Iran; C613 RCB; RCB0485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007242
CLO; CLO_0050264 MCCL; MCC:0000284 CLDB; cl3170 CLDB; cl3171 cancercelllines; CVCL_0389 DSMZCellDive; ACC-673 LINCS_LDP; LCL-1987 Lonza; 1157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0000935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472329
BioSample; SAMN03473428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54901878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
GEO; GSM313804 GEO; GSM333799 GEO; GSM692871 GEO; GSM2371239 GEO; GSM2394369 GEO; GSM4104579 GEO; GSM4104580 GEO; GSM4104628 GEO; GSM4104629 GEO; GSM4105313 GEO; GSM4105314 GEO; GSM4105315 GEO; GSM4105316 GEO; GSM4105317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 801742
Cosmic; 920242 Cosmic; 923828 Cosmic; 930066 Cosmic; 947705 Cosmic; 1037345 Cosmic; 1099142 Cosmic; 1109122 Cosmic; 1153783 Cosmic; 1161992 Cosmic; 1167989 Cosmic; 1212538 Cosmic; 1518068 Cosmic; 1526629 Cosmic; 1890201 Cosmic; 2131580 Cosmic; 2239462 Cosmic; 2301576 Cosmic; 2393636 IARC_TP53; 21459 Progenetix; CVCL_0389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |