Cellosaurus HCA7 (CVCL_0289)
Cell line name | HCA7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCA-7; HCA 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCA7 (RRID:CVCL_0289) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: KuDOS 95 cell line panel. Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=25926053). Omics: Deep proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from sampling site: Colon. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio; ECACC; PubMed=25877200; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cellosaurus.org/pawefish/ColonCellLineDescriptions/HCA7.html https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-584.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4016751 PubMed=3718830; DOI=10.1038/bjc.1986.132 PubMed=8410493; DOI=10.1002/path.1711700407 PubMed=8464898; DOI=10.1073/pnas.90.7.2842 PubMed=9294210; DOI=10.1073/pnas.94.19.10330 PubMed=10737795; DOI=10.1073/pnas.97.7.3352 PubMed=11226274; DOI=10.1073/pnas.041603298 PubMed=16418264; DOI=10.1073/pnas.0510146103 PubMed=18258742; DOI=10.1073/pnas.0712176105 PubMed=20570890; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-0192 PubMed=20606684; DOI=10.1038/sj.bjc.6605780 PubMed=24755471; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-0013 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=29101300; DOI=10.15252/msb.20177701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; C0009003/40
ECACC; 06061902 Ximbio; 152451 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | MCCL; MCC:0000179
ColonAtlas; HCA7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCA7_445_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM741260 GEO; GSM1346872 GEO; GSM1374491 GEO; GSM1374492 GEO; GSM1448125 GEO; GSM3145708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 876722
Cosmic; 948860 Cosmic; 985995 Cosmic; 995407 Cosmic; 1043813 Cosmic; 1223140 Cosmic; 1312301 Cosmic; 1479629 Cosmic; 1486131 Cosmic; 1805252 Cosmic; 1933017 Cosmic; 2301976 Cosmic; 2760084 IARC_TP53; 21760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD005354
PRIDE; PXD005355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |