Cellosaurus SF172 (CVCL_V613)
Cell line name | SF172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SF-172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_V613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SF172 (RRID:CVCL_V613) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Probably misidentified/contaminated. Except of a loss of an allele of TH01 the STR profile of SF172 is identical to that of SF763. Furthermore we could not find in the literature any trace of the exact origin of SF172 and, according to a personal communication of Shai A. from the UCSF Biorepository, there is no record of SF172 in their system while SF763 is registered there. The TP53 mutation recorded for SF763 is also identical to the one in SF172. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Doubling time: 24 hours (PubMed=25984343). Omics: Deep exome analysis. Omics: shRNA library screening. Derived from site: In situ; Brain; UBERON=UBERON_0000955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Glioblastoma (NCIt: C3058) Glioblastoma (ORDO: Orphanet_360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_6949 (SF763) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 36Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-000887 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_V613
Cell_Model_Passport; SIDM01351 DepMap; ACH-000887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10988399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SF172_1365_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 2516034
Progenetix; CVCL_V613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 16-Apr-2014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 17 |