Cellosaurus YD-38 (CVCL_L083)
Cell line name | YD-38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | YD38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_L083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: YD-38 (RRID:CVCL_L083) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Korean. Doubling time: 21.6 hours (PubMed=16264262). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Oral cavity, gingiva; UBERON=UBERON_0001828. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Gingival squamous cell carcinoma (NCIt: C129857) Squamous cell carcinoma of the oral cavity (ORDO: Orphanet_502363) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 67Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=60508; PubMed=16264262 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=16264262; DOI=10.1038/emm.2005.48 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=28053903; DOI=10.5125/jkaoms.2016.42.6.337; PMCID=PMC5206238 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 60508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_L083
Cell_Model_Passport; SIDM01412 DepMap; ACH-000762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10988077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; YD38_1682_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54995388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887745 GEO; GSM888840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | IARC_TP53; 21621
IARC_TP53; 30220 LiGeA; CCLE_758 Progenetix; CVCL_L083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-May-2013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |