Cellosaurus YD-8 (CVCL_L079)
Cell line name | YD-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | YD8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_L079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: YD-8 (RRID:CVCL_L079) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Korean. Doubling time: 29.3 hours (PubMed=16264262). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Oral cavity, tongue; UBERON=UBERON_0001723. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Tongue squamous cell carcinoma (NCIt: C4648) Squamous cell carcinoma of the oral tongue (ORDO: Orphanet_457252) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=60501; PubMed=16264262 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=16264262; DOI=10.1038/emm.2005.48 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23708675; DOI=10.3892/ijo.2013.1953; PMCID=PMC3775581 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28053903; DOI=10.5125/jkaoms.2016.42.6.337; PMCID=PMC5206238 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 60501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM01413
DepMap; ACH-000630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10988082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; YD8_1683_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54995393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887746 GEO; GSM888841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | IARC_TP53; 21616
LiGeA; CCLE_283 Progenetix; CVCL_L079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-May-2013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |