Cellosaurus NCI-H1339 (CVCL_A472)
Cell line name | NCI-H1339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | H1339; H-1339; NCIH1339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_A472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_2052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCI-H1339 (RRID:CVCL_A472) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Partially contaminated. Some cultures of NCI-H1339 are contaminated with NCI-H157 or NCI-1264 (PubMed=25877200). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00534. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_2637 ! NCI-BL1339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 49Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-506; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1312696 PubMed=1565469 PubMed=8806092; DOI=10.1002/jcb.240630505 PubMed=8806103; DOI=10.1002/jcb.240630516 PubMed=9559342; DOI=10.1002/(SICI)1098-2264(199804)21:4<308::AID-GCC4>3.0.CO;2-2 PubMed=11030152; DOI=10.1038/sj.onc.1203815 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=19472407; DOI=10.1002/humu.21028; PMCID=PMC2900846 PubMed=20557307; DOI=10.1111/j.1349-7006.2010.01622.x; PMCID=PMC11158680 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-5979 - Discontinued
DSMZ; ACC-506 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_A472
Cell_Model_Passport; SIDM01387 DSMZCellDive; ACC-506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473058
BioSample; SAMN10987986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; NCIH1339_1008_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887356 GEO; GSM888434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 877376
Cosmic; 980946 Cosmic; 1032416 Cosmic; 1239942 Cosmic; 1513490 Cosmic; 1891911 Cosmic; 2125227 IARC_TP53; 427 LiGeA; CCLE_064 Progenetix; CVCL_A472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |