Cellosaurus UM-SCC-47 (CVCL_7759)
Cell line name | UM-SCC-47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | UMSCC-47; UMSCC47; UM-SCC47; UM:SCC047; UMSCC047; University of Michigan-Squamous Cell Carcinoma-47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_7759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: UM-SCC-47 (RRID:CVCL_7759) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: OPC-22 oral and pharyngeal cancer cell line panel. Virology: Contains from 21 to 47 copies of the HPV16 genome (PubMed=24201445). Doubling time: 2.2 days (PubMed=29156801). Transformant: NCBI_TaxID; 333760; Human papillomavirus type 16 (HPV16). Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced (low read coverage). Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: UPCI:SCC47; GEO=GSM937830; GEO=GSM937831. Derived from site: In situ; Oral cavity, tongue, lateral border; UBERON=UBERON_0011877. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Tongue squamous cell carcinoma (NCIt: C4648) Squamous cell carcinoma of the oral tongue (ORDO: Orphanet_457252) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 53Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Millipore=SCC071; PubMed=19760794; PubMed=21868764; PubMed=25275298; PubMed=29156801; PubMed=33802339 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=12884349; DOI=10.1002/hed.10274 PubMed=17312569; DOI=10.1002/hed.20478 PubMed=17848307; DOI=10.1016/j.ijrobp.2007.04.082 PubMed=19760794; DOI=10.1002/hed.21198; PMCID=PMC3292176 PubMed=21868764; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-11-0690; PMCID=PMC3229662 PubMed=23419152; DOI=10.1186/gm419; PMCID=PMC3706778 PubMed=24201445; DOI=10.1101/gr.164806.113; PMCID=PMC3912410 PubMed=25275298; DOI=10.18632/oncotarget.2417; PMCID=PMC4253406 PubMed=26045983; PMCID=PMC4449432 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=28236344; DOI=10.1002/hed.24729; PMCID=PMC5392184 PubMed=29156801; DOI=10.18632/oncotarget.21174; PMCID=PMC5689691 PubMed=31541927; DOI=10.1016/j.oraloncology.2019.09.004; PMCID=PMC7372097 PubMed=32574978; DOI=10.1016/j.tranon.2020.100808; PMCID=PMC7317296 PubMed=33802339; DOI=10.3390/cancers13051069; PMCID=PMC7959143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | Millipore; SCC071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_7759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54990870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM937830
GEO; GSM937831 GEO; GSM3631278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1122677
Cosmic; 2131865 Cosmic; 2296309 IARC_TP53; 21103 Progenetix; CVCL_7759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |