Cellosaurus DiFi (CVCL_6895)
Cell line name | DiFi | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | DIFI | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_6895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: DiFi (RRID:CVCL_6895) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~40 hours (PubMed=8385096). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=25926053; Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Miscellaneous: Formerly the CCRID database had an entry describing this cell line (3111C0002000000030). It was one of the sources for the STR profile of this entry. Derived from site: Metastatic; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Colorectal carcinoma (NCIt: C2955) Gardner syndrome (NCIt: C6728) Gardner syndrome (ORDO: Orphanet_79665) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID; Cosmic-CLP=1789883; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/978-4-431-68337-7_80 PubMed=8385096; DOI=10.1007/BF02634191 PubMed=20570890; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-0192; PMCID=PMC2943514 PubMed=22270724; DOI=10.1038/nm.2609 PubMed=22722830; DOI=10.1038/nature11156; PMCID=PMC3927413 PubMed=25623215; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-14-2821 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28854368; DOI=10.1016/j.celrep.2017.08.010; PMCID=PMC5583477 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCB; KCB 2014033YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_6895
Cell_Model_Passport; SIDM00049 Cosmic-CLP; 1789883 DepMap; ACH-002233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0005902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1789883
PharmacoDB; DIFI_291_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_6895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54831091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSM1448175 GEO; GSM1669732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1479628
Cosmic; 1519358 Cosmic; 2841360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD005235
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |