Cellosaurus HCC461 (CVCL_5135)
Cell line name | HCC461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC0461; Hamon Cancer Center 461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC461 (RRID:CVCL_5135) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 69Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10353731 PubMed=16187286; DOI=10.1002/ijc.21491 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5135
Cell_Model_Passport; SIDM01595 DepMap; ACH-000339 IGRhCellID; HCC461GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471006
BioSample; SAMN10989603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC461_505_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM62336 GEO; GSM108877 GEO; GSM108878 GEO; GSM253392 GEO; GSM434262 GEO; GSM794380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 903632
Cosmic; 1146938 Cosmic; 2699648 IARC_TP53; 11446 Progenetix; CVCL_5135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |