Cellosaurus HCC193 (CVCL_5130)
Cell line name | HCC193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-193; HCC0193; Hamon Cancer Center 193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC193 (RRID:CVCL_5130) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Doubling time: 45.5 hours (PubMed=29681454). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Miscellaneous: Direct author submission of STR profile from Girard, Luc and Gazdar, Adi F. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_S838 ! HCC193 BL | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 80Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Direct_author_submission; PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9559342; DOI=10.1002/(SICI)1098-2264(199804)21:4<308::AID-GCC4>3.0.CO;2-2 PubMed=10987304 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=16187286; DOI=10.1002/ijc.21491 PubMed=19472407; DOI=10.1002/humu.21028; PMCID=PMC2900846 PubMed=20557307; DOI=10.1111/j.1349-7006.2010.01622.x; PMCID=PMC11158680 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5130
IGRhCellID; HCC193GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC193_484_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM62334 GEO; GSM108865 GEO; GSM108866 GEO; GSM253372 GEO; GSM434260 GEO; GSM794377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 877256
Cosmic; 903629 Cosmic; 1146929 Cosmic; 1239872 Cosmic; 1518093 Cosmic; 2125260 IARC_TP53; 28436 Progenetix; CVCL_5130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |