Cellosaurus SNU-1033 (CVCL_5002)
Cell line name | SNU-1033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU1033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-1033 (RRID:CVCL_5002) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Population: Korean. Doubling time: 42 hours (PubMed=10362137). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10674020; PubMed=25926053). Omics: Deep exome analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Rectum; UBERON=UBERON_0001052. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Rectal adenocarcinoma (NCIt: C9383) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 45Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=01033; PubMed=25926053; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10362137; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19990611)81:6<902::AID-IJC11>3.0.CO;2-T PubMed=10674020; DOI=10.1016/S0959-8049(99)00206-3 PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 01033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5002
Cell_Model_Passport; SIDM00192 ColonAtlas; SNU1033 DepMap; ACH-000286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10987752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SNU1033_1433_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM1448078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 738855
Cosmic; 2612379 Cosmic; 2651858 IARC_TP53; 10837 LiGeA; CCLE_623 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |