Cellosaurus SNU-216 (CVCL_3946)
Cell line name | SNU-216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU216; NCI-SNU-216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-216 (RRID:CVCL_3946) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Population: Korean. Doubling time: 36 hours (PubMed=29435981). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric tubular adenocarcinoma (NCIt: C5473) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=00216; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9033653; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19970207)70:4<443::AID-IJC12>3.0.CO;2-G PubMed=15723654; DOI=10.1111/j.1349-7006.2005.00016.x; PMCID=PMC11160020 PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25343454; DOI=10.1371/journal.pone.0111146; PMCID=PMC4208810 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29435981; DOI=10.1002/ijc.31304 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 00216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_3946
Cell_Model_Passport; SIDM01393 CGH-DB; 124-1 CGH-DB; 9012-4 DepMap; ACH-000466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0004988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473182
BioSample; SAMN10988071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SNU216_1451_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM887617 GEO; GSM888701 GEO; GSM1374887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685589
Cosmic; 848139 Cosmic; 1067205 Cosmic; 1090453 Cosmic; 1151969 Cosmic; 1528874 Cosmic; 2484970 IARC_TP53; 7418 LiGeA; CCLE_434 Progenetix; CVCL_3946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |