Cellosaurus RKO-E6 (CVCL_3787)
Cell line name | RKO-E6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RKOE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RKO-E6 (RRID:CVCL_3787) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Genetic integration: Method=Transfection; Gene=UniProtKB; P03126; Human papillomavirus type 16 protein E6. Genetic integration: Method=Transfection; Gene=UniProtKB; P00552; Transposon Tn5 neo. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0504 (RKO) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Sex unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2578; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8387205; DOI=10.1073/pnas.90.9.3988; PMCID=PMC46431 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2578
CLS; 305135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008827
cancercelllines; CVCL_3787 CCRID; 3101HUMTCHu118 Cell_Model_Passport; SIDM01253 ColonAtlas; RKOE6 IGRhCellID; RKOE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471683
BioSample; SAMN03472970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; RKOE6_1317_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54950558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1184102
Cosmic; 1187317 Progenetix; CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |