Cellosaurus T1-73 (CVCL_3605)
Cell line name | T1-73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | TI-73; T173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_1772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: T1-73 (RRID:CVCL_3605) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a osteosarcoma cell line but using a variety of omics methods was shown to be a a fibroblastic cell line (DOI=10.1101/166199; DepMap=ACH-000529). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone; UBERON=UBERON_0002481. Cell type: Fibroblast; CL=CL_0000057. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_N340 ! F1-73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Sex unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Undefined cell line type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-7943 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 DOI=10.1101/166199 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-7943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009241
cancercelllines; CVCL_3605 Cell_Model_Passport; SIDM01765 DepMap; ACH-000529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471127
BioSample; SAMN10987677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308222
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366158 GDSC; 910696 PharmacoDB; TI73_1594_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_3605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM185158 GEO; GSM185159 GEO; GSM827271 GEO; GSM887682 GEO; GSM888774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687932
Cosmic; 910696 IARC_TP53; 27709 IARC_TP53; 30177 LiGeA; CCLE_417 Progenetix; CVCL_3605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |