Cellosaurus BGC-823 (CVCL_3360)
Cell line name | BGC-823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | BGC823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BGC-823 (RRID:CVCL_3360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a HeLa derivative (CCRID; PubMed=26116706; PubMed=28851942). Originally thought to be a gastric adenocarcinoma. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00570. Population: African American. Transformant: NCBI_TaxID; 333761; Human papillomavirus type 18 (HPV18). Omics: Proteome analysis by 2D-DE. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Miscellaneous: Formerly the CCRID database had 2 entries describing this cell line (3111C0001CCC000062, 3131C0001000700011). They were one of the sources for the STR profile of this entry. Misspelling: BSG823; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Uterus, cervix; UBERON=UBERON_0000002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Human papillomavirus-related cervical adenocarcinoma (NCIt: C27677) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0030 (HeLa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 30Y6M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID; PubMed=26116706; PubMed=28851942; PubMed=29717028 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=16344271; DOI=10.1093/carcin/bgi306 PubMed=26116706; DOI=10.1096/fj.14-266718 PubMed=28851942; DOI=10.1038/s41598-017-09660-w; PMCID=PMC5575032 PubMed=29717028; DOI=10.1042/BSR20180277; PMCID=PMC6050193 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CCTCC; GDC0151
ICLC; HTL98007 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001952
Cell_Model_Passport; SIDM01938 DepMap; ACH-001017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307635
ChEMBL-Targets; CHEMBL614526 PharmacoDB; BGC823_90_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_3360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54796238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM828793
GEO; GSM843444 GEO; GSM1374404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 2267322
IARC_TP53; 24859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |