Cellosaurus Farage (CVCL_3302)
Cell line name | Farage | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | FARAGE; Farage OL; Farage Original Line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Farage (RRID:CVCL_3302) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 48 hours (DOI=10.3109/10428199209053591). Microsatellite instability: Instable (MSI-low) (PubMed=31068700; Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lymph node; UBERON=UBERON_0000027. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Diffuse large B-cell lymphoma germinal center B-cell type (NCIt: C36080) Diffuse large B-cell lymphoma (ORDO: Orphanet_544) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 70Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; DepMap Markers:
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Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.3109/10428199209053591 PubMed=9172815; DOI=10.3109/10428199609093448 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11378582; DOI=10.3109/10428190109060355 PubMed=19278952; DOI=10.1182/blood-2009-01-202028 PubMed=19358282; DOI=10.1002/ijc.24351 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=20628145; DOI=10.1182/blood-2010-05-282780 PubMed=23292937; DOI=10.1073/pnas.1205299110 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2630
CCTCC; GDC0319 CLS; 305071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002997
cancercelllines; CVCL_3302 CCRID; 4201HUM-CCTCC00319 Cell_Model_Passport; SIDM00859 Cosmic-CLP; 1297449 DepMap; ACH-001498 IGRhCellID; Farage LINCS_LDP; LCL-1131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4483171
ChEMBL-Targets; CHEMBL4483236 GDSC; 1297449 PharmacoDB; Farage_366_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_3302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54833249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM380125 GEO; GSM552429 GEO; GSM907525 GEO; GSM1035331 GEO; GSM1374481 GEO; GSM1669792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1295510
Cosmic; 1517602 Cosmic; 1541919 Cosmic; 1945180 Cosmic; 2022591 Cosmic; 2276315 Progenetix; CVCL_3302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD028647
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 05-Oct-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |