Cellosaurus T.T (CVCL_3174)
Cell line name | T.T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | T-T; T_T_; T. T; tdott; TT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: T.T (RRID:CVCL_3174) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 27 hours (Note=At 50th passage) (DOI=10.5794/jjoms.36.307); 40 hours (PubMed=25984343); ~1.2 days (Note=Lot 09262006), 28-38 hours (Note=Lot 10132015) (JCRB=JCRB0262). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Bone, jaw, mandible; UBERON=UBERON_0001684. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal squamous cell carcinoma (NCIt: C4024) Squamous cell carcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99977) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_3175 ! T.Tn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 67Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1299064; JCRB=JCRB0262; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.5794/jjoms.36.307 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009935
cancercelllines; CVCL_3174 Cell_Model_Passport; SIDM00322 Cosmic-CLP; 1299064 DepMap; ACH-000561 LINCS_LDP; LCL-1561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470960
BioSample; SAMN10988191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3989362
GDSC; 1299064 PharmacoDB; T_T_1555_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_3174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827520 GEO; GSM887713 GEO; GSM888806 GEO; GSM1670549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 923184
IARC_TP53; 21664 LiGeA; CCLE_660 Progenetix; CVCL_3174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |