Cellosaurus RERF-LC-OK (CVCL_3154)
Cell line name | RERF-LC-OK | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RERF-LCOK; RERFLCOK; LC-OK; LCOK; Radiation Effects Research Foundation-Lung Cancer-OK | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RERF-LC-OK (RRID:CVCL_3154) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a Marcus derivative (PubMed=20143388). Originally thought to originate from a lung adenocarcinoma. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00344. Population: Caucasian. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: PERF-LC-OK; Cosmic=2125286. Misspelling: REAF-LC-OK; Cosmic=1571720. Misspelling: RERF-LOCK; IARC_TP53=11873; PubMed=10536175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Astrocytoma (NCIt: C60781) Astrocytoma (ORDO: Orphanet_94) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_3019 (Marcus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): JCRB=JCRB0811; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://cellbank.nibiohn.go.jp/legacy/cellbank/qualitycontrol/identification/summary.htm https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7834619 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=10536175; DOI=10.3892/ijo.15.5.927 PubMed=11005564; DOI=10.1038/sj.neo.7900094; PMCID=PMC1550293 PubMed=14581340 PubMed=15185009; DOI=10.1007/s00262-004-0533-9; PMCID=PMC11034254 PubMed=15746151; DOI=10.1093/hmg/ddi092 PubMed=16105816; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-05-0331 PubMed=19472407; DOI=10.1002/humu.21028; PMCID=PMC2900846 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=20557307; DOI=10.1111/j.1349-7006.2010.01622.x; PMCID=PMC11158680 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0811 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_3154
Cell_Model_Passport; SIDM00385 CGH-DB; 207-1 CGH-DB; 9167-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151836
BioSample; SAMN03471743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; RERFLCOK_1307_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54949775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM274667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 753609
Cosmic; 801580 Cosmic; 876139 Cosmic; 889096 Cosmic; 917974 Cosmic; 932927 Cosmic; 934469 Cosmic; 946065 Cosmic; 1066168 Cosmic; 1219088 Cosmic; 1239899 Cosmic; 1571720 Cosmic; 2125286 Cosmic; 2668321 IARC_TP53; 11873 IARC_TP53; 28443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |